林木高質量遺傳圖譜構建和QTL精確定位統計方法及套用

林木高質量遺傳圖譜構建和QTL精確定位統計方法及套用

《林木高質量遺傳圖譜構建和QTL精確定位統計方法及套用》是依託南京林業大學,由童春發擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:林木高質量遺傳圖譜構建和QTL精確定位統計方法及套用
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:童春發
  • 依託單位:南京林業大學
  • 批准號:30872051
  • 申請代碼:C1610
  • 負責人職稱:教授
  • 研究期限:2009-01-01 至 2011-12-31
  • 支持經費:30(萬元)
中文摘要
由於林木具有複雜的生物學特性,其遺傳連鎖圖譜構建和數量性狀基因座(QTL)定位的統計分析方法一直沒有得到很好的發展。本研究利用林木F1代群體,採用不同的分子標記,如RAPD 、RFLP、SSR、AFLP、ISSR、EST等,建立兩點和多位點連鎖分析的統計模型,使得象1:1、1:2:1、1:1:1:1及3:1等分離比的位點能夠同時進行連鎖分析;對於一個連鎖群,尋找最佳的排序算法對標記進行排序,從而構建連鎖群中包含多達上百個的分子標記並最大程度地接近真實排序的高質量遺傳連鎖圖譜。同時,建立多種適合林木自身特點的QTL定位的統計分析模型,以提高林木QTL作圖的精確性。在此理論基礎上,編寫構建林木遺傳連鎖圖譜和QTL定位的可視化統計分析軟體,供林木遺傳育種學家使用。最後,利用現有響葉楊x銀白楊的F1代作圖群體,構建楊樹高質量的遺傳連鎖圖譜,並對楊樹季節性休眠性狀的QTL進行精確定位。

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