《杜洛克豬生長與免疫力性狀遺傳相關機制研究》是依託上海交通大學，由潘玉春擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：杜洛克豬生長與免疫力性狀遺傳相關機制研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：潘玉春
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
我國每年引進一兩萬頭種豬。但因豬場內外環境較差、免疫程式複雜，引進品種的豬往往生產性能每況愈下、死亡率高、育種值的排序發生變化。為了探明其中原因，本項目擬在分子水平上開展下列工作：（1）分析已知生長QTL與免疫力QTL間的關係，藉以初步探明二者一因多效、基因連鎖、基因互作等遺傳相關的基礎與機制；（2）運用簡化基因組測序數據通過全基因組尤其是免疫相關SNP、InDel、CNV等的比較，分析清潔環境+簡單免疫條件下育種對免疫力的影響；（3）通過生長與免疫指標測定、簡化基因組測序及進一步的GWAS，分析環境與遺傳的互作及不同環境與免疫程式條件下生長與免疫力的遺傳相關機制；（4）在細胞水平上驗證生長與免疫力相關基因的效應；（5）建立國內環境與免疫程式條件下GS參考群及資料庫。通過這些工作，將使我們正確認識引種，探明不同環境與免疫條件下生長與免疫力的相關機制，為我國自主育種奠定必要的基礎。
結題摘要
我國每年引進一兩萬頭種豬。但因豬場內外環境較差、免疫程式複雜，引進品種的豬往往生產性能每況愈下、死亡率高、育種值的排序發生變化。為了探明其中原因，本項目在分子水平上開展了下列工作：①我們首先注釋了生長與免疫性狀之間QTL交集區段，定位了豬基因組上的生長與免疫間的一因多效基因與基因集。同時，基於人類GWAS的摘要統計量，我們發現生長與免疫的遺傳相關主要為負相關。而利用GWAS結果在豬上的同源基因，我們進一步擴充了豬基因組上的各類多效性基因，最終確定了豬基因組上生長與免疫之間482一因多效基因、8個一因多效連鎖區間以及29條一因多效通路。②對杜洛克豬群體在生長性狀上利用美國環境的信息與中國環境的信息所估計的育種值進行對比，發現在生長速度性狀上兩組育種值相關係數為-0.3，即發生了遺傳與環境互作。我國豬場的免疫程式複雜，這一結果的出現提示我們必須更新引種以及後續育種策略。③對起源於同一個群體而處於中、美兩個環境下的杜洛克豬群體進行了基因組對比分析。結果發現二者呈現了顯著分化，分化信號與免疫和肉質性狀相關。而且，在免疫相關的信號上，處於我國環境下的群體更加靠近有更好免疫力的太湖豬群體。同時，我們發現中西方豬群體之間最顯著的分化信號落生長與免疫的一因多效基因IGF1R內部。而我國地方豬群體近期的選擇信號在生長與免疫一因多效性基因集中達到富集，可見基因組上的多效性在中西方豬種種質特性形成中發揮了作用。④同時，我們利用一組丹麥奶牛的繁殖數據，驗證了基於遺傳與環境互作的基因組選擇模型的套用可能性，並對我國的杜洛克豬群體利用SNP晶片、簡化基因組測序、重測序進行了基因型檢測，為後續開展我國環境下的杜洛克豬群體的全基因組選擇奠定了基礎。
