《滇撒豬配套系主要經濟性狀遺傳機制研究》是依託上海交通大學，由潘玉春擔任項目負責人的聯合基金項目。
基本介紹
- 中文名：滇撒豬配套系主要經濟性狀遺傳機制研究
- 項目類別：聯合基金項目
- 項目負責人：潘玉春
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
滇撒豬配套系是以著名的地方豬種撒壩豬為母本，長白、大白為第一、第二父本育成的三系配套系，具有繁殖力高、肉質好、耐粗飼、適應性強等特點，為地方品種的保護、選育、利用提供了一種行之有效的模式。本項目用高通量富集測序檢測基因組的SNP，進而依據現有群體繁殖記錄、育肥試驗、屠宰試驗以及肉質分析，開展下列工作： 1、繁殖性狀的全基因組關聯分析；2、粗飼料與豬生長發育、胴體組成、肉質間的關係及其遺傳機制分析；3、比較基因組學和正向選擇信號分析。這些工作旨在揭示滇撒豬種質特性的遺傳機制，尤其是在繁殖、生長、耐粗飼、胴體組成及肉質方面，包括關聯的SNP、基因、通路、網路等，從而為這種含地方品種、規模小、不適宜採用“大規模測定＋BLUP 遺傳評估”等常規育種手段進行遺傳改良的特殊配套系的保種、選種及選配提供有效手段。該研究將對地方豬種保護及我國未來豬的育種工作奠定必要的基礎。
結題摘要
項目以滇撒豬配套系的撒壩豬作為核心，以與其配套的長白豬、大白豬作為重點，以雲南省其他地方品種及太湖豬、杜洛克豬等作為參照，藉助1800餘頭豬的高通量測序及繁殖試驗、育肥試驗、屠宰試驗以及肉質分析，開展了一系列研究工作並取得了大量重要的研究結果：（1）完善了信息登記管理平台，基於系譜信息和基因組SNP信息分析了撒壩豬保種群的遺傳結構。（2）對撒壩豬、大白豬以及長撒二元雜種三個群體進行了GWAS和顯著基因的功能注釋，證實了撒壩豬在繁殖性能上耐粗飼的種質特性，發現了多個與撒壩豬繁殖性狀相關聯的遺傳標記、基因與基因集，利用選擇信號分析交叉核實驗證了繁殖相關基因ADCY5、AANAT等。（3）套用構建的“杜撒×大長撒”分離群體進行耐粗飼試驗，找到了大量與胴體及肉質相關的基因，驗證了撒壩豬相較於大白豬具有更高的耐粗飼能力，而這種能力的主要原因或與脂肪相關代謝通路關聯。同時，找到了與脂肪相關候選基因ALDOC。（4）套用“基因組→性狀”的分析策略找到了與肉質（BACH2，SORCS1）、生長（LTBP2）、繁殖（LEP，GRB10，BMP7）、高原適應（TRAPPC9，ADAMTS12）相關的候選基因，並揭示了撒壩豬與長白豬、大白豬等在腸道發育候選基因上的差異。（5）利用候選基因法與轉錄組測序等手段，對部分生長、繁殖、肉質相關的基因進行了驗證，並基於人類增強子數據信息，開發了豬的增強子資料庫用於部分基因的調控序列注釋。這些工作在一定程度上揭示了撒壩豬種質特性優良及滇撒豬三系配套效果良好的遺傳機制，尤其是在繁殖、生長、耐粗飼、胴體組成及肉質方面，包括關聯的SNP、基因、通路、網路等，從而為地方品種保護及其雜交配套與配套系的持續選育奠定了必要的基礎。課題執行期間發表標註SCI論文11篇，中文文章6篇，申請發明專利3項，軟體著作權4項。另有4篇SCI文章正在撰寫準備投稿。對照課題任務書，課題組圓滿完成了任務。
