“九五”以來，以孔子儒學研究為特色的專門史是山東省強化建設的重點學科，孔子文化研究院先後被山東省確定為“儒學研究基地”（十五）、“儒學研究中心”（十一五）、“孔子與傳統文化研究中心”（十二五）、“山東省一流學科”（十三五）。一大批專門從事孔子儒家文化、中國儒學史、孔子儒家文獻、儒家文物古蹟、孔子文化傳播研究及服務社會的專家匯聚於此，形成了一隻由海內外知名學者組成的實力雄厚、優勢集成、機構合理的專兼職隊伍。目前，我院專職研究人員30人，其中教授12人（博士生導師5人，儒學泰山學者1人，山東省突出貢獻專家1人，山東省高端智庫人才1人），副教授8人（碩士生導師7人，泰山專家青年學者1人），講師和博士8人；校內外兼職人員50餘人。
我院設有以孔子儒學及儒家文獻為研究方向的博士點、博士後流動站，招收中國史、孔子儒學及儒家文獻、儒家文化等方向的博士、碩士生。
六十餘年來，我院取得了豐碩的成果，在各類學術期刊發表論文兩千餘篇，出版孔子儒學專著四百餘部。傅永聚教授2013年獲批國家重大招標項目“歷代孔子檔案文獻集成與研究及全文資料庫建設”，馬士遠教授研究成果《兩漢尚書學研究》入選國家社科最高榮譽“國家哲學社會科學成果文庫”，並榮獲山東省第二十八次哲學社會科學重大成果獎。至今，我院承擔國家重大招標、國家社科基金等各類科研課題二百餘項，獲國家、省部級獎勵近百項，在國內外產生了廣泛深遠的影響。
我院藏書總計25萬餘冊，其中線裝古籍2萬餘冊，藏有《四庫全書》、《四部叢刊》、《叢書集成初編》、《四部備要》等大型叢書，訂有報刊雜誌180餘種，珍貴歷史文物200餘件，中外文資料庫20多個，另有大量的多媒體文獻。
我院多次舉辦國內外儒學學術會議，廣泛進行交流，與數十個國家和地區的專家學者建立了學術聯繫。
我院設有以孔子儒學及儒家文獻為研究方向的博士點、博士後流動站，招收中國史、孔子儒學及儒家文獻、儒家文化等方向的博士、碩士生。
六十餘年來，我院取得了豐碩的成果，在各類學術期刊發表論文兩千餘篇，出版孔子儒學專著四百餘部。傅永聚教授2013年獲批國家重大招標項目“歷代孔子檔案文獻集成與研究及全文資料庫建設”，馬士遠教授研究成果《兩漢尚書學研究》入選國家社科最高榮譽“國家哲學社會科學成果文庫”，並榮獲山東省第二十八次哲學社會科學重大成果獎。至今，我院承擔國家重大招標、國家社科基金等各類科研課題二百餘項，獲國家、省部級獎勵近百項，在國內外產生了廣泛深遠的影響。
我院藏書總計25萬餘冊，其中線裝古籍2萬餘冊，藏有《四庫全書》、《四部叢刊》、《叢書集成初編》、《四部備要》等大型叢書，訂有報刊雜誌180餘種，珍貴歷史文物200餘件，中外文資料庫20多個，另有大量的多媒體文獻。
我院多次舉辦國內外儒學學術會議，廣泛進行交流，與數十個國家和地區的專家學者建立了學術聯繫。
1956年12月，在曲阜師範大學首任校長、新儒家傳人高贊非領導下成立了孔子研究會，1979年1月24日更名為孔子研究室；經山東省人民政府批准，1983年2月8日更名為孔子研究所，後更名為孔子文化研究院。
