新疆棉花產業技術創新戰略聯盟針對棉花產業發展的技術需求，通過選育高光效、高產、超高產、優質、多抗、特早熟、專用、機采等多類型新品種，實現棉花新品種在高產、抗逆、專用等方面繁育突破；通過技術創新和轉化，重點開展高效超高產栽培技術研究、水肥高效利用調控管理技術研究、棉花重大蟲害防治技術研究及全程機械化關鍵機具及配套模式研製；對高效生產技術進行集成配套，重點開展以棉花品種為核心，不同生態區域、不同灌溉模式、不同產量水平下的多模式生產技術體系以及建立果棉、麥棉等復播（套作）高效生產技術體系構建，保障棉花高產穩產；通過完善產業各環節技術標準，創新產業技術體系，實現產業各環節的技術對接，原棉生產與紡織市場需求高效聯動，提高棉花產業整體質量和市場競爭力；著力棉副產品開發與綜合利用技術，提高棉籽、棉稈、棉殼的利用價值，尋求產業新的增值點，帶動棉花產業綜合效益的全面提高；通過加強條件建設，構建棉花區域科技轉化與服務平台，加快產業信息技術集成套用，促進技術、生產、市場的緊密結合。
