新生肽鏈伴同翻譯摺疊過程的動態蒙特卡羅模擬研究

新生肽鏈伴同翻譯摺疊過程的動態蒙特卡羅模擬研究

《新生肽鏈伴同翻譯摺疊過程的動態蒙特卡羅模擬研究》是依託深圳大學,由陳彥濤擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:新生肽鏈伴同翻譯摺疊過程的動態蒙特卡羅模擬研究
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:陳彥濤
  • 依託單位:深圳大學
  • 批准號:20804023
  • 申請代碼:B0406
  • 負責人職稱:副教授
  • 研究期限:2009-01-01 至 2011-12-31
  • 支持經費:18(萬元)
項目摘要
作為聯繫遺傳信息與生物功能的橋樑,蛋白質摺疊一直是科學界的研究熱點和難點之一。與完整多肽鏈的體外再摺疊過程不同,新生肽鏈很可能在尚未完全合成之前即已開始摺疊,是一個邊合成、邊摺疊的伴同翻譯摺疊過程。目前的實驗工作集中於獲取核糖體上新生肽鏈的靜態摺疊狀態或三維結構,尚未涉及伴同翻譯摺疊過程中鏈構象的動態調整過程;而已有的模擬工作大多採用高度粗粒化的格子模型,難以形成精細的二級結構,無法對動態過程進行更深入的研究。申請人擬通過構建含有明確二級結構(α-螺旋)和三級結構,且二級結構片斷不能穩定獨立存在的模型蛋白,藉助於中等粗粒化程度的四單元非格子模型以及動態蒙特卡羅模擬方法,模擬新生肽鏈的伴同翻譯摺疊過程;並引入分子伴侶,考察其對新生肽鏈摺疊構象的穩定功能,以求在新生肽鏈伴同翻譯摺疊的動態調整過程、對分子伴侶的依賴性關係以及與體外再摺疊的異同等方面獲得初步認識,並為後續實驗探索提供參考和指導。

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