數學動力學模型:在生物物理和生物化學中的套用

數學動力學模型:在生物物理和生物化學中的套用

《數學動力學模型:在生物物理和生物化學中的套用》是2017年4月1日北京大學出版社出版的圖書,作者是葛顥、錢紘。

基本介紹

  • 中文名:數學動力學模型:在生物物理和生物化學中的套用
  • 作者:葛顥,錢紘
  • 出版時間:2017年4月1日
  • 出版社:北京大學出版社
  • 頁數:236 頁
  • ISBN:9787301280324
  • 類別:建模
  • 定價:68 元
  • 開本:16 開
  • 裝幀:平裝
  • 版次:1
  • 千字數:221
  • 叢書名:北京大學現代數學叢書
內容簡介,編輯推薦,圖書目錄,

內容簡介

本書系統講解與細胞生物學、分子生物學以及神經生物學等有關的生物物理及生化系統建模方面的知識和方法,主要的數學工具會涉及常微分方程、機率論和隨機過程等。本書的特點在於用數學的語言描述和刻畫化學過程和生命活動,在不失嚴格性的同時豐富學生的眼界,讓他們領略到學科交叉的魅力。

編輯推薦

本書是田剛院士主編的“北京大學現代數學叢書”之一,系統地論述了數學動力學模型在生物物理及生物化學中的套用,並給出了一些新的研究成果。

圖書目錄

第一部分 背景知識
第一章 學科背景與細胞生物學基礎
第二部分 確定性動力學模型
第二章 質量作用定律和化學平衡態動力學簡介
§21 反應動力學方程: 原子守恆和質量作用定律
§22 熱力學與反應常數
§23 化學平衡態動力學和細緻平衡條件
§24 閉化學反應系統的平衡態是全局漸近穩定的
閱讀材料 習題
第三章 經典米氏酶動力學理論
§31 酶:作為催化劑的蛋白質
§32 產物生成率和倒易關係
§33 Michaelis-Menten 理論
§34 別構合作效應
閱讀材料 習題
§41 相圖、不動點及其穩定性
§42 分岔理論
第五章 信號傳導系統的確定性動力學:超靈敏度、反饋和分岔
§51 信號開關的典型動力學
§52 磷酸化(去磷酸化環中的米氏酶動力學)
§53 具有反饋的磷酸化(去磷酸化環)
閱讀材料 習題
第六章 細胞電生理學,神經元興奮性和 Hodgkin-Huxley 理論 67
§61 電化學勢:Nernst-Planck 方程 67
§62 Hodgkin-Huxley 模型 69
§63 FitzHugh-Nagumo 模型 77
§64 神經網路和 Hopˉeld 以內容設定地址的存儲模型 79
第七章 生物化學振盪與鈣動力學 84
§71 生物化學振盪和 Hopf 分岔 84
§72 鈣動力學基本生物知識 86
§73 鈣離子振盪 88
§74 鈣釋放的具體機制 92
閱讀材料 習題 96
第八章 中心法則與細胞調控:操縱子 100
§81 色氨酸操縱子:負反饋 101
§82 乳糖操縱子:正反饋 104
閱讀材料 習題 108
第九章 協助擴散和電擴散 110
§91 細胞膜的結構 110
§92 擴散過程的一般理論 111
§93 協助擴散 114
§94 電擴散: Goldman-Hodgkin-Katz 電流方程
閱讀材料 118 習題 119
第三部分 隨機性動力學模型
第十章 重要機率分布及隨機過程簡介 123
§101 機率論基本知識 123
§102 高斯分布和布朗運動 126
§103 泊松分布和泊松過程 130
§104 單分子反應的隨機模型簡介 134
§105 具有產生和降解的簡單非單分子化學反應系統 139
§106 一般連續時間馬爾可夫鏈簡介 140
第十一章 隨機單分子酶動力學與化學非平衡定態隨機理論 145
§111 單分子米氏酶動力學隨機理論 145
§112 漲落酶和動力學合作 155
§113 修飾子的激發|抑制轉換 158
§114 動力學校對和特異性放大 160
閱讀材料 習題 164
第十二章 化學主方程 166
§121 化學主方程簡單實例 166
§122 單細胞中心法則的化學主方程模型 171
§123 建立化學主方程的一般方法 178
閱讀材料 習題 180
第十三章 大偏差、非平衡態景觀函式和單細胞表型遷移速率理論 181
§131 大偏差基本知識
§132 單細胞正反饋磷酸化去磷酸化信號開關的化學主方程 模型
§133 單細胞自調控基因轉錄翻譯的化學主方程模型 192
閱讀材料 202
第十四章 高聚物模型 204
§141 靜態構象的統計物理模型 205
§142 動力學模型
§143 蛋白質摺疊模型
閱讀材料 習題
參考文獻 索引

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