支行轄內往來對帳方法是指支行轄內往來對帳的通常做法。它根據分行轄內往來對帳的基本原則，一般採取“直接往來，分別核算，集中監督，逐筆配卡對帳”的核算辦法。但由於僅為一個縣（市）範圍，具有機構數量多少不等，且距離較近，業務比較單純等實際情況，故各地具體作法不盡一致。
其特點主要有：科目設定不盡相同，有的在“支行轄內往來”科目內，分設“往帳戶”和“來帳戶”；有的在這一科目下，另設“縣轄往帳”、“縣轄來帳”、“已核對縣轄來帳”三個科目核算日常帳務，會計報表上報總行時併入一個科目反映。有的農村信用社參加“縣轄”，故規定信用社為非對帳單位，它定期向管轄營業所報帳，由營業所併入本身一起負責對帳。採取營業所相互對帳的，則由各處、所按月編制“縣轄往帳報告表”上報支行，支行設立“縣轄往來登記簿”，用以監督、檢査和匯總平衡，一般只設郵劃代收、代付憑證，不辦電劃。鑒於一個縣屬機構多為農村營業所，故習慣稱往帳行為“甲所”，來帳行為“乙所”。
