其作用是將UQH2的電子經FP傳給O2生成H2O。其P/O為1。該酶不為
氰化物等所抑制,易被所水楊基羥肟酸(
水楊羥肟酸)抑制。交替氧化酶的分子量為27×10^3~37×10^3,是一種雙鐵羧基蛋白(di-iron carboxylate protein),Fe2+是其活性中心的金屬。它不僅具有其它雙鐵
羧基蛋白共有的結構特點以及去除分子氧的功能,更重要的是它還可以通過改變自身結構等方式來主動調節
抗氰呼吸途徑的運行程度,進而調節細胞多方面的代謝和功能,以適應環境條件的改變,增強植物適應各種逆境的能力,調節植物生長速率,並與
細胞凋亡和
光合作用相關。