打分函式(scoring function)是2018年公布的生物物理學名詞。
基本介紹
- 中文名:打分函式
- 外文名:scoring function
- 所屬學科:生物物理學
- 公布時間:2018年
打分函式(scoring function)是2018年公布的生物物理學名詞。
打分函式(scoring function)是2018年公布的生物物理學名詞。定義用於評價理論獲得的受體–配體結合模式合理性的函式。目的在於挑選出天然狀態下的複合物結構。可用於分子對接及虛擬篩選的受體–配體間結合親和性的...
為了解決可用實驗數據少的難點和提高精度,將利用目前較先進的DFIRE算法[1,2]和我們最新發展的自由旋轉(free-rotating)和自避(self-avoiding)鏈模型[3]等思路來發展基於統計平均勢的通用打分函式。分子對接算法擬基於我們最新的PSI-...
例100 在AVERAGEIF函式中使用通配符 89 例101 計算出滿足多重條件的數據的平均值 91 例102 求指定班級的平均分且忽略0值 92 例103 在AVERAGEIFS函式中使用通配符 92 例104 通過10位評審打分計算出選手的最後得分 93 例105 ...
我們將針對分子對接方法的兩個難點:打分函式和分子柔性展開研究。通過複合物結構分析,構造新的胺基酸-鹼基成對勢函式,結合課題組前期發展的多種打分方法,設計適合於蛋白質-核酸對接不同階段評價的打分函式。構象搜尋將綜合考慮分子柔性和...
黃勝友,是華中科技大學教授。研究方向有生物物理和生物信息學。具體為分子對接、打分函式、生物分子相互作用和結構的建模與預測、計算機輔助藥物設計以及複雜網路在生物相互作用系統中的套用。個人簡介 黃勝友,1998年獲武漢大學材料物理專業理學...
代表性成果有對蛋白-配體相互作用打分函式的研究、蛋白-配體複合物資料庫、配體分子的自動設計方法等。所發展的藥物設計軟體在60多個國家擁有6500餘名註冊用戶。同時,注重在實踐中套用藥物設計技術,選擇Bcl-2家族等蛋白-蛋白作用體系作為...
3dRNA v2.0版本改進包括採用了新的整體框架,擴展了 3D 模板庫,增加了採樣方法,最佳化方法和打分函式,並且可以選取四種不同類型的預測任務。3dRNA v2.0除了上述資料庫和功能的升級外,對假節的預測也採取了新的策略,把假節中的殘基...
算法,提高了計算速度;DOCK 3.0採用分子力場勢能函式作為評價函式;DOCK 3.5引入了打分函式最佳化以及化學性質匹配等;DOCK4.0開始考慮配體的柔性;DOCK 5.0在前面版本基礎上,採用C++語言重新編程實現,並進一步引入GB/SA打分。
基於受體的虛擬篩選從靶蛋白的三維結構出發,研究靶蛋白結合位點的特徵性質以及它與小分子化合物之間的相互作用模式,根據與結合能相關的親合性打分函式對蛋白和小分子化合物的結合能力進行評價,最終從大量的化合物分子中挑選出結合模式比較...
方昭庚,男 , 解放軍第458醫院 神經內科 醫師 論文 不同打分函式對虛擬篩選乙醯膽鹼酯酶抑制劑富集率的影響 《廣州醫學院學報》2010年38卷1期 21-26頁 葛慶波 羅巧雲 王真真 方昭庚 劉述 簡易腦立體定向微創液化軟通道對高...
該數據集將為我們進一步開發RNA-蛋白質相互作用的打分函式提供關鍵的支持。最後,設計或者發現一個能夠阻斷蛋白質-蛋白質相互作用的小分子或者多肽藥物仍然是非常困難的問題。蛋白質與蛋白質結合過程如果存在構象變化,那么其動態的結合過程中...
本項目基於完成人2003年提出的“反向對接”識別化合物體內作用靶標的方法,分析了該方法的不足之處,通過建立“序位回歸”的統計方法修正分子對接打分函式中的“蛋白間噪音”,建立了更為精確的識別化合物體內作用靶標的計算方法。套用這...
採用經過驗證的打分函式以及特定的描述符,評價受體-配體間的相互作用。通過對LigandFit對接結果的分析,可幫助用戶確定結合模式方面可能存在的問題,區分正確或錯誤的結合構象,把不同結合構象的配體依次排序以供篩選或合成使用。可自定義參數...
模擬/分析、構建三維分子、展示動態變化、三維作圖等功能;2. 分子力學及動力學程式,研究多種分子(從小分子配體到多組分的複合物)的熱力學及動力學特性;3. 快速、靈活的分子對接程式,包括柔性對接功能;4. 採用經過驗證的打分函式...
.4.3 時間序列打分函式的比較81 4 .5 結論82 4 .6 未來工作82 第 5章 基於多預處理機制的統計詞對齊融合84 5 .1 引言84 5 .2 相關工作84 5.3 阿拉伯語的預處理機制85 5 .4 對齊的預處理機制86 5 .4.1 犌犻狕犪++...
此外還存在著其他眾多的方法:probit法、因子(logistic)法、模糊數學方法、混沌法及突變級數法、灰關聯熵、主成分分析綜合打分法、主成分分析與理想點的結合方法、原蟻群算法、數據包絡判別法等等。關於這些方法的套用,將在後面的實證部分...
6.5計算機出題、判卷、打分(變數的存儲類型)6.5.1分析與設計 6.5.2局部變數的存儲類型 6.5.3全局變數的存儲類型 6.5.4實戰演練 6.6快速計算三角形的面積(編譯預處理)6.6.1分析與設計 6.6.2宏定義命令 6.6.3檔案...