我國部分城市環境水系中軍團菌分離株遺傳多態性研究

《我國部分城市環境水系中軍團菌分離株遺傳多態性研究》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院,由宋亞軍擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:我國部分城市環境水系中軍團菌分離株遺傳多態性研究
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:宋亞軍
  • 依託單位:中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院
中文摘要,結題摘要,

中文摘要

軍團菌是重要的胞內寄生病原菌,能引起軍團菌病,對人民健康構成威脅。本課題擬首次採集我國內陸30個省會城市的環境水系(包括主要江河以及城市湖泊等)水樣,進行軍團菌分離培養;通過表型分析與核酸序列分析,確定我國非嗜肺軍團菌環境菌株的構成,有望發現一批軍團菌新種;對於嗜肺軍團菌,採用血清學分型、基於序列的分型(Sequence-based Typing)、多位點VNTR分析(Multi-locus VNTR Analysis,MLVA)以及基因組序列測定等技術,研究其群體遺傳學結構與系統發育關係;通過研究環境菌株中毒力基因分布情況,對其侵染潛力進行預評估。菌株遺傳多態性數據結合地理信息,有助於了解軍團菌環境菌株微進化規律以及系統發生模式。本課題的開展將系統了解我國重要城市環境水體中軍團菌環境污染情況、本底組成以及遺傳多態性,對於預防和控制突發性軍團菌病的暴發流行、進行快速病原學診斷提供科學依據。

結題摘要

軍團菌是重要的胞內寄生病原菌,能引起軍團菌病,對人民健康構成威脅。軍團菌病不能在人與人之間傳播,只能由環境傳播到人類,因此加強軍團菌環境菌株的研究,對於軍團菌病的溯源,研究臨床菌株與環境菌株之間的關係等都有重要意義。本研究首次關注我國主要城市自然水體中軍團菌的分布情況,取得以下重要結果: 1.建立了從環境水體中高效分離軍團菌的方法,熱富集濃縮預處理方法的培養陽性率顯著高於離心濃縮和膜過濾濃縮處理水樣的培養陽性率。 2.在我國31個城市自然水體中採集了550份水樣,從中分離到404株非冗餘軍團菌,其中嗜肺軍團菌146株,占36.1%,是最常見的軍團菌。在非嗜肺軍團菌中,長灘軍團菌、菲氏軍團菌和戈爾曼軍團菌最常見。只有兩個城市(拉薩和西寧)水樣中未分離到軍團菌。軍團菌的種類在各個城市間的分布存在著差異。75份水樣同時存在兩種以上的不同軍團菌,顯示在中國的自然水環境中,軍團菌普遍存在且具有高度的多態性。 3.我們140株嗜肺軍團菌進行了序列分型(sequence-based typing, SBT),可分為84個序列型(STs),多樣性指數為0.988 (95% CI: 0.983-0.992),84個序列型中有31個序列型與EWGLI的SBT資料庫中已有序列型相同,53個為首次發現的新序列型,同時還發現11個新的等位基因。 4.群體遺傳學分析表明, 140株嗜肺軍團菌形成10個克隆複合體(clonal complexes,CCs)和47個singletons,其中CCI為中國自然水環境中的優勢克隆複合體,有兩個(ST239和ST1439)為致病序列型,提示CCI菌株可能會引起疾病。而中國人工環境中最常見的ST1-克隆複合體在自然水環境中並不是很常見,在本研究的140株菌中,未發現基因內重組事件,但發現了多個基因間重組事件。 5.通過比較發現,不同環境與地區菌株在分子水平上的差異並不顯著,但自然水環境菌株與人工水環境菌株之間卻存在著顯著的差異,前者遺傳多樣性明顯高於後者。 本課題首次摸清了我國重要城市環境水體中軍團菌環境污染情況、本底組成以及遺傳多態性,對於預防和控制突發性軍團菌病的暴發流行、進行快速病原學診斷具有重要意義。

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