志願計算

由中國科學院高能物理研究所牽頭、中科院計算技術研究所等單位共同參與的中國科學院志願計算項目CAS@home於2010年10月投入正式運行。

基本介紹

• 中文名：志願計算
• 運行時間：2010年10月
• 用戶數：6000多人
• 屬於：志願者項目

發展

據悉，CAS@home是國內第一個正式投入運行的志願計算項目，它標誌著中國志願計算進入一個新的發展階段。 志願計算是通過網際網路讓全球的普通大眾志願提供空閒的PC時間，參與科學計算或數據分析的一種計算方式。這種方式為解決基礎科學運算規模較大、計算資源需求較多的難題提供了一種行之有效的解決途徑。對於科學家而言，志願計算意味著近乎免費且無限的計算資源；而就志願者而言，他們可以得到一個了解科學、參與科學的機會，以促進公眾對科學的理解。

目前，志願計算已成為一種較為成熟的技術，運行在主流的志願計算平台BOINC（伯克利開放式網路計算平台）上的世界各地的志願計算項目已超過100個，數百萬的志願者參與其中。在中國，志願計算的發展還處於起步階段。

CAS@home是在CERN（歐洲粒子物理研究所）的幫助下於2010年1月在中科院高能所啟動的。其主要目標是推動志願計算思想在中國的發展。項目伺服器於今年2月份部署完成；其後與中國科學院計算技術研究所合作，進行蛋白質結構預測套用的部署。

蛋白質的功能由其結構所決定，蛋白質結構測定對生物理論、醫學、製藥等領域意義重大。由於DNA序列測定技術的迅猛發展和實驗方法測定結構的局限，用計算的方法來預測結構顯得越來越重要。目前，穿線法（Threading）是主流的蛋白質結構預測方法，它主要通過將未知蛋白質序列與已知蛋白質結構庫進行對比，從而對未知的蛋白質結構作出預測。通常已知蛋白質結構庫都非常龐大，因此對計算資源的需求量也非常大，志願計算恰恰為其提供了一個很好的平台。

解出的蛋白質結構

影響

目前運行在CAS@home上的蛋白質結構預測套用軟體是由中科院計算所研究員卜東波等人開發，依據蛋白質結構聯配時出現的short-cut現象提出的一種高效的結構預測方法。

據悉，CAS@home於今年6月13日正式開始測試。測試之初得到了廣大中國志願者，特別是中國分散式計算論壇上諸多志願者的支持，志願者用戶快速增長。8月加入BOINCstats後，用戶數量更是經歷了一個質的飛躍，至2010年底已達6000多人。