微生物功能基因組學

《微生物功能基因組學》是2007年4月1日化學工業出版社出版的圖書，作者是周集中。本書主要講述了微生物的基因，微生物的功能等內容。

基本介紹

• 中文名：微生物功能基因組學
• 作者：周集中
• 出版社：化學工業出版社
• 出版時間：2007年4月1日
• 定價：69.0
• 開本：16 開
• ISBN：9787502599218

目錄

第1章基因組學

1.1引言

作者周集中

1.2定義和分類

1.3基因組學的歷史回顧

1.4研究功能基因組學的挑戰

1.5範圍和一般方法

1.6微生物功能基因組學在真核生物研究中的重要性

1.7總結

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第2章微生物多樣性與基因組學

2.1引言

2.2生物化學多樣性

2.3基因多樣性

2.4描述原核生物多樣性的挑戰

2.5微生物基因組多樣性和全基因組測序

2.6總結

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第3章計算基因組注釋

3.1引言

3.2編碼蛋白質基因的預測

3.3編碼RNA基因的預測

3.4鑑定啟動子

3.5操縱子的鑑定

3.6基因的功能類別

3.7基因組中其他性質的特性描述

3.8基因組尺度的基因作圖

3.9現有的基因組注釋系統

3.10總結

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第4章微生物進化的基因組學

4.1引言

4.2直向進化同源基因的鑑定

4.3基因組中的分子鐘

4.4水平基因轉移的基因組

4.5基因重複、基因缺失和其他進化過程的基因組學

4.6系統進化樹

4.7最小基因組

4.8基於生活方式進化的基因組學觀點

4.9基因組學有關線粒體進化的觀點

4.10總結

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第5章基因功能預測的計算方法

5.1引言

5.2基因功能推斷的方法

5.3從基因序列到功能

5.4序列基序的鑑定

5.5以結構為基礎的功能預測

5.6非同源的方法進行功能推斷

5.7在系統水平上的功能推斷

5.8總結

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第6章DNA微陣列技術

6.1引言

6.2微陣列的種類和優點

6.3微陣列製造

6.4微陣列雜交和檢測

6.5微陣列圖像處理

6.6用微陣列技術去監測基因表達

6.7總結

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第7章微陣列基因表達譜數據分析

7.1引言

7.2微陣列基因表達數據的歸一化

7.3數據分析

7.4差異表達基因的識別

7.5共表達基因的識別

7.6基因表達數據分析在途徑推理的套用

7.7總結

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第8章誘變

8.1引言

8.2轉座子誘變

8.3通過等位基因交換進行定向突變

8.4反義mRNA分子導致基因沉默

8.5總結

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第9章質譜

9.1引言

9.2質譜的基本原理

9.3蛋白質和肽的質譜基礎

9.4蛋白質和蛋白質組鑑定中的質譜

9.5總結

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第10章蛋白質?配體相互作用的鑑定

10.1引言

10.2可讀框的高通量克隆

10.3酵母雙雜交選擇系統

10.4使用噬菌體展示來檢測蛋白質?配體的相互作用

10.5在蛋白片段互補實驗中檢測相互作用

10.6利用質譜儀研究蛋白質?蛋白相互作用的圖譜

10.7蛋白表達譜以及相互作用中的蛋白質陣列

10.8表面細胞質基因組共振生物感測器分析

10.9總結

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第11章模式生物的功能基因組學：從新的視角看老問題

11.1引言

11.2大腸桿菌：模式真細菌

11.3枯草芽孢桿菌（Bacillussubtilis）：革蘭陽性菌的典範

11.4釀酒酵母：高等真核生物的模型

11.5模式真核生物的比較基因組學

11.6總結

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第12章病原菌與環境中重要微生物的功能基因組分析

12.1引言

12.2通過基因組序列與功能注釋研究細菌的致病機理

12.3比較基因組學：研究細菌致病性的線索

12.4用信號物標記突變來發現新的感染相關基因

12.5套用微陣列描繪基因的功能和相互作用

12.6病原菌的蛋白質組學

12.7環境中重要微生物的基因組測序以及功能分析

12.8總結

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第13章基因組學對抗菌藥物發現及毒理學的影響

13.1引言

13.2抗生素藥物的發現：歷史回顧

13.3新藥開發所遇到的挑戰

13.4微生物基因組學和藥物靶點的篩選

13.5確定治療用途：藥物靶點篩選和驗證

13.6基因組學和毒理學：毒物基因組學的產生

13.7總結

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第14章微陣列基因組技術在突變分析和微生物檢測中的套用

14.1引言

14.2寡核苷酸微陣列用於突變分析

14.3微陣列用於自然環境中微生物的檢測

14.4總結

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第15章展望未來：基因組學將超越單細胞學

15.1引言

15.2微生物學的信息基礎：基因組序列

15.3基因功能和表達調控網路

15.4生態學和進化

15.5系統水平理解微生物群落動力學

15.6總結

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