基本介紹
- 中文名：張洪
- 畢業院校：中國科學技術大學
- 學位/學歷：博士
- 專業方向：統計計算，大數據分析
- 任職院校：中國科學技術大學
- 職稱：中國科學技術大學教授
人物經歷,研究方向,論文專著,
人物經歷
1993.9-1997.6，中國科大數學系計算數學及其套用軟體專業，獲理學學士學位。
1997.9-2000.6，中國科大數學系套用數學專業攻讀碩士學位，獲理學碩士學位。
2000.7-2011，中國科大統計與金融系，助教/講師。
2001.2-2003.12，中國科大統計與金融系機率論與數理統計專業，獲理學博士學位。
2004.3-2005.4，喬治華盛頓大學統計系（postdoctoral scientist）
2006.8-2007.11，耶魯大學醫學院（postdoctoral associate）
2009.1-2010.12，美國NIH國立癌症研究所（postdoctoral visiting fellow）
2011.2-2018.5，復旦大學生物統計學研究所，研究員、博導。
2018.6至今，中國科大統計與金融系，教授、博導。
研究方向
1、統計計算
2、大數據分析
3、生物統計
論文專著
(1) Adjustment of non-confounding covariates in case-control genetic associaiton studies - Annals of Applied Statistics - 2018年 - 12(1): 200-221
(2) AntCaller: An accurate variant caller incorporating ancient DNA damage - Molecular Genetics and Genomics - 2017年 - 292(6): 1419-1430
(3) armDNA: A functional beta model for detecting age-related genomewide DNA methylation marks - Statistical Methods in Medical Research - 2016年 - DOI: 10.1177/0962280216683571
(4) multiDE: A dimension reduced model based statistical method for differential expression analysis using RNA-sequencing data from multiple conditions - BMC Bioinformatics - 2016年 - 17: 248
(5) contamDE: Differential expression analysis of RNA-seq data for contaminated tumor samples - Bioinformatics - 2016年 - 32(5): 705-712
(6) MAFsnp: A Multi-sample Accurate and Flexible SNP Caller Using Next-generation Sequencing Data - PLoS ONE - 2015年 - 10(8): e0135332
(7) PLNseq: a multivariate Poisson lognormal distribution for high-throughput matched RNA-sequencing read count data - Statistics in Medicine - 2015年 - 34: 1577-1589
(8) Semiparametric inference on the penetrances of rare genetic mutations based on a case-family design - Journal of Statistical Planning and Inference - 2013年 - 143: 368-377
(9) Influence of population stratification on population based marker-disease association analysis - Annals of Human Genetics - 2010年 - 74:351-360
(10) Statistical inference on the penetrances of rare genetic mutations based on a case-family design - Biostatistics - 2010年 - 11:519-532
(11) Large sample interval mapping method for genetic trait loci in finite regression mixture models - Journal of Statistical Planning and Inference - 2009年 - 139:764-779
(12) Genotypic association analysis using discordant-relative-pairs - Annals of Human Genetics - 2009年 - 73:84-94
(13) Analysis of least absolute deviation - Biometrika - 2008年 - 95:107-122
(14) Statistical methods for haplotype-based matched case-control association studies - Genetic Epidemiology - 2007年 - 31:316-326
(15) Statistical analysis for haplotype-based matched casecontrol studies - Biometrics - 2006年 - 62:1124-1131
