張弓(暨南大學生命科學技術學院 研究員   博導)

張弓(暨南大學生命科學技術學院 研究員   博導)

張弓,男 , 博士 ,博導,暨南大學生命科學技術學院研究員。

學習經歷:
1998-2001 武漢大學國家生物學人才培養基地
2003-2005 德國漢堡科技大學(TU Hamburg-Harburg) 生物技術(生化工程)碩士學位
2005-2008 德國馬克思-普朗克研究員生物化學所(Max-Planck Institut für Biochemie) 攻讀博士學位
2008-2009 隨導師搬遷至德國波茨坦大學(Universität Potsdam),獲博士學位。博士論文與答辯獲得德國最高成績(summa cum laude,最高榮譽)。
工作經歷:
2004-2005 Evotec Technologies 德國漢堡
套用計算器視覺、人工智慧技術、仿生學技術,研發高通量藥物篩選系統的樣品全自動分析模組(單系統 >10萬樣品/天),客戶包括德國Fraunhofer研究院、美國史丹福大學等。
2009-2011 德國波茨坦大學 博士後研究
2010 倫敦大學學院(University College London) 訪問學者
2011至今 暨南大學
研究方向:
生化與分子生物學(研究重點:翻譯組學與翻譯控制)、生物信息學
主要論文:
Zhang, G., Hubalewska, M., & Ignatova, Z.*, Transient ribosomal attenuation coordinates protein synthesis and co-translational folding. Nature Structural and Molecular Biology, 16(3):274-80 (2009).
Zhang, G., & Ignatova, Z.*, A generic algorithm to predict the speed of translational elongation: implications for protein biogenesis. PLoS One, 4(4):e5036 (2009).
Zhang, G., Fedyunin, I., Miekley, O., Valleriani, A., Moura A. & Ignatova, Z.*, Global and local depletion of ternary complex limits translational elongation. Nucleic Acid Res, (2010) 38(14):4778-87
Zhang, G. & Ignatova, Z.*, Folding at the birth of the nascent chain: Coordinating translation with co-translational folding. Current Opinion of Structural Biology, (2011) 21:25-31.
Zhang, G., Lukoszek, R., Mueller-Roeber, B., Ignatova, Z.*, Different sequence signatures in the upstream regions of plant and animal tRNA genes shape distinct modes of regulation. Nucleic Acid Res. (2011) 39(8):3331-9
Zhang, G.*, Fedyunin, I., Kirchner, S., Xiao, C., Valleriani, A. & Ignatova, Z.*, FANSe: an accurate algorithm for quantitative mapping of large scale sequencing reads. Nucleic Acid Res. 40 (11): e83 (2012)
Fedyunin I, Lehnhardt L, Böhmer N, Kaufmann P, Zhang G, Ignatova Z*. tRNA concentration fine tunes protein solubility. FEBS Lett. 21;586(19):3336-40 (2012)
Xiao CL, Chen XZ, Du YL, Sun X, Zhang G *, He QY *. Binomial probability distribution model-based protein identification algorithm for tandem mass spectrometry utilizing peak intensity information. J Proteome Res. 12(1):328-35 (2013)
Wang T *, Cui Y, Jin J, Guo J, Wang G, Yin X, He QY *, Zhang G*. Translating mRNAs strongly correlate to proteins in a multivariate manner and their translation ratios are phenotype-specific. Nucleic Acids Res (2013) 41 (9): 4743-4754.
Xiao CL, Chen XZ, Du YL, Li ZF, Wei L, Zhang G*, He QY*. Dispec: a novel Peptide scoring algorithm based on Peptide matching discriminability. PLoS ONE (2013) 8(5):e62724
承擔課題:
2012年教育部重點項目:細胞進行異源蛋白質表達時的tRNA組變化
2012年教育部博士點項目:結直腸癌體外腫瘤微環境中細胞間傳遞的核酸信息及其對靶細胞翻譯組的影響
所授課程:
【研究生課程】生物信息學導論
【研究生課程】功能蛋白質研究
【本科生課程】國際學院 細胞生物學(全英授課)
【本科生課程】生物信息學
社會職務:
國際德爾斐藝術委員會(International Delphic Council)顧問
中國人類蛋白質組學計畫研究骨幹成員
PNAS, Bioinformatics等期刊通訊審稿人
國家自然科學基金委項目通訊評審專家
廣東省“千百十工程”省級培養對象
廣東省企業科技特派員

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