張塏，福建福州人。廈門大學學士、碩士，加州大學聖地亞哥分校生物信息學博士。2019年開始在加州大學聖地亞哥分校進行博士後研究，致力於單細胞表觀遺傳組學分析工具的開發與套用。2023年加入西湖大學，任特聘研究員、博士生導師。
基本介紹
- 中文名：張塏
- 國籍：中國
- 出生地：福州
- 畢業院校：廈門大學、加州大學聖地亞哥分校
- 學位/學歷：博士
- 專業方向：計算與調控基因組學
人物經歷,研究方向,代表論文,
人物經歷
2009年畢業於廈門大學生命科學學院生物科學專業，獲學士學位；
2012年獲廈門大學分子生物學與生物化學碩士學位；
2012-2018年在加州大學聖地亞哥分校攻讀生物信息學博士學位，從事真核生物基因調控網路的研究；
2019-2023年在加州大學聖地亞哥分校進行博士後研究；
2023年加入西湖大學生命科學學院。
研究方向
調控基因組學實驗室聚焦基因轉錄調控，通過計算生物學和機器學習等跨學科手段揭示細胞分化、衰老以及疾病的表觀遺傳學機制。張塏實驗室旨在開發創新性的生物信息學和機器學習方法，用於系統性地構建轉錄調控的計算模型，並從基因調控的角度解釋非編碼基因變異與疾病間的聯繫。其當前的研究集中在幾個關鍵領域，包括：（1）開發針對超大規模單細胞多模態數據的整合分析工具，（2）通過分析單細胞多組學數據構建基因轉錄調控網路，（3）通過整合時態數據和功能基因組數據構建基因轉錄調控的動態模型，以及（4）揭示非編碼基因突變的致病機制。
代表論文
*These authors contribute equally
1. Zhang, K.*, Hocker, J. D.*, Miller, M., Hou, X., Chiou, J., Poirion, O. B., ... Ren, B. A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome. Cell (2021)
2. Zhang, K., Wang, M., Zhao, Y., & Wang, W. Taiji: System-level identification of key transcription factors reveals transcriptional waves in mouse embryonic development. Science Advances (2019)
3. Yu, B.*, Zhang, K.*, Milner, J., Toma, C., Chen, R., Scott-Browne, J., ... Goldrath, A. Epigenetic landscapes reveal transcription factors that regulate CD8+ T cell differentiation. Nature Immunology (2017)
4. Zhang, K., Li, N., Ainsworth, R., & Wang, W. Systematic identification of protein combinations mediating chromatin looping. Nature Communications (2016)
5. Li, Y. E.*, Preissl, S.*, Hou, X., Zhang, Z., Zhang, K., Qiu, Y., ... Ren, B. An atlas of gene regulatory elements in adult mouse cerebrum. Nature (2021)
