張力，男，北京腦科學與類腦研究中心基因組學中心&計算中心主任。主要研究方向為“高通量測序和數據分析服務，深度學習套用開發和高性能計算服務，智力演化研究。”
基本介紹
- 中文名：張力
- 性別：男
人物經歷,研究概述,發表文章,
人物經歷
2018.12至今北京腦科學與類腦研究中心，基因組學中心主任&計算中心主任
2018.03-2018.11 耶魯大學醫學院遺傳系，研究科學家
2017.03-2017.12 芝加哥大學演化與遺傳系，研究科學家
研究概述
達爾文演化的核心是選擇找出並保留適應性突變。當好壞突變連鎖時，選擇無法有效找出適應性突變，積累新基因。性重組在動植物中打破了好壞突變連鎖，加速了基因演化。同理，適應性免疫起源於早期脊椎動物，打破了好壞細胞的連鎖，從而加速了脊椎動物的細胞演化。細胞演化的直接產物是細胞類型多樣化，細胞類型實質對應調控序列演化，是動物演化的主要驅動力。人類智力是脊椎動物的重要創新，極可能是細胞演化的產物。
基於既往工作衍生的理論框架，未來五年將研究新細胞類型對智力演化的貢獻。通過單細胞測序技術比較果蠅近緣物種全腦細胞類型，鑑定新細胞類型，研究其對智力的影響。果蠅不是脊椎動物，但是新蛋白數量同樣稀少。該研究會對細胞演化的概念創新提供有效支撐，且指向一個極其重要的問題——智力演化。
該研究需要建立高質量的單細胞測序技術平台，但更為重要的是要在概念上解決什麼是細胞類型。最清晰的辦法是通過物種間保守性來區分噪音。此前新基因領域的工作基礎可以通過等位基因映射，將物種間比較分析虛擬化為“單一”物種分析，迅速建立多物種細胞類型比較方法。
發表文章
1. Zhu Q*, Shao Y*, Wang Z*, Chen X, Li C, Liang Z, Jia M, Guo Q, Zhao H, Kong L, Zhang L. DeepS: A web server for image optical sectioning and super resolution microscopy based on a deep learning framework [J]. Bioinformatics, 2021.
2. Yu W B#, Tang G D, Zhang L, Corlett R T. Decoding the evolution and transmissions of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2 / HCoV-19) using whole genomic data [J]. Zool Res, 2020, 41(3): 247-257.
3. Zhang L*, Ren Y*, Yang T, Li G, Chen J, Gschwend A R, Yu Y, Hou G, Zi J, Zhou R, Wen B, Zhang J, Chougule K, Wang M, Copetti D, Peng Z, Zhang C, Zhang Y, Ouyang Y, Wing R A#, Liu S#, Long M#. Rapid evolution of protein diversity by de novo origination in Oryza [J]. Nat Ecol Evol, 2019, 3(4): 679-690.
4. Stein J C, Yu Y, Copetti D, Zwickl D J, Zhang L, Zhang C, Chougule K, Gao D, Iwata A, Goicoechea J L, Wei S, Wang J, Liao Y, Wang M, Jacquemin J, Becker C, Kudrna D, Zhang J, Londono C E M, Song X, Lee S, Sanchez P, Zuccolo A, Ammiraju J S S, Talag J, Danowitz A, Rivera L F, Gschwend A R, Noutsos C, Wu C C, Kao S M, Zeng J W, Wei F J, Zhao Q, Feng Q, El Baidouri M, Carpentier M C, Lasserre E, Cooke R, Rosa Farias D D, da Maia L C, Dos Santos R S, Nyberg K G, McNally K L, Mauleon R, Alexandrov N, Schmutz J, Flowers D, Fan C, Weigel D, Jena K K, Wicker T, Chen M, Han B, Henry R, Hsing Y C, Kurata N, de Oliveira A C, Panaud O, Jackson S A, Machado C A, Sanderson M J, Long M, Ware D, Wing R A. Genomes of 13 domesticated and wild rice relatives highlight genetic conservation, turnover and innovation across the genus Oryza [J]. Nat Genet, 2018, 50(2): 285-296.
5. Gao G*, Vibranovski M D*, Zhang L, Li Z, Liu M, Zhang Y E, Li X, Zhang W, Fan Q, VanKuren N W, Long M#, Wei L#. A long-term demasculinization of X-linked intergenic noncoding RNAs in Drosophila melanogaster [J]. Genome Res, 2014, 24(4): 629-638.
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8. Liu M*, Liu P*, Zhang L, Cai Q, Gao G, Zhang W, Zhu Z, Liu D#, Fan Q#. mir-35 is involved in intestine cell G1/S transition and germ cell proliferation in C. elegans [J]. Cell Res, 2011, 21(11): 1605-1618.
9. Zhao S Q, Wang J, Zhang L, Li J T, Gu X, Gao G#, Wei L#. BOAT: Basic Oligonucleotide Alignment Tool [J]. BMC Genomics, 2009, 10 Suppl 3(S2).
10. Li Z*, Liu M*, Zhang L*, Zhang W, Gao G, Zhu Z, Wei L, Fan Q#, Long M#. Detection of intergenic non-coding RNAs expressed in the main developmental stages in Drosophila melanogaster [J]. Nucleic Acids Res, 2009, 37(13): 4308-4314.
