廣西出入境檢驗檢疫局通關業務處

負責對全區系統的通關、檢務、統計、質量分析匯總、原產地和口岸開放等綜合業務的管理，負責對外檢驗檢疫業務協調、口岸特殊監管區檢驗檢疫基礎設施規劃驗收等工作；管理檢驗檢疫標誌標識、證單和原產地證簽證；依法審批、監督管理從事與檢驗檢疫通關業務有關的社會服務機構的資質資格。
內設科室有口岸管理科、檢務科。