巴林金融制度是巴林金融結構及其體系的制度。是以中央銀行 (貨幣署) 為核心，商業銀行、投資銀行和其他金融機構並存的，對外國銀行不加限制、不繳存款準備金、不徵收稅款的體系。貨幣總署成立於1974年1月。它行使中央銀行職能，負責發行貨幣，制訂有關銀行管理和監督的法規，統一組織貨幣，制訂有關銀行管理和監督的法規，統一組織貨幣流通，管理信貸，維持幣值穩定;進行外匯黃金買賣，管理銀行機構和制度。貨幣總署的領導機構是理事會，由6名理事組成，理事由財政國民經濟部部長推薦，經內閣批准任命，任期3年，可以連任。理事會的職責是決定貨幣和信貸政策，決定有關貨幣發行、流通和回籠等事項，決定貸款利率、商業票據貼現的手續費，對銀行和其他金融機構的管理和監督，審批貨幣總署的年度會計報告等。
離岸銀行是巴林金融機構中的主體。這類銀行不得從事國內放款業務，不得提供轉賬結算便利。它的主要經營範圍是：在歐洲貨幣市場上吸收活期、定期、儲蓄存款; 開展即期或遠期外匯交易; 經營歐洲債券、票據和股票等。離岸銀行可以吸收大額的政府及其他銀行的存款，且可向外國借款人提供中期貸款。離岸銀行在巴林開業要經貨幣局批准，每家銀行每年還需上繳1000巴林第納爾的經營手續費。離岸銀行可免繳盈利稅和個人所得稅，並很少受到當地政府的干預。
巴林最大的三家商業銀行，是巴林國民銀行、巴林—科威特銀行和奧哈商業銀行。巴林是自由貿易國家，對外資銀行不但沒有限制，還採取積極吸收外資銀行的政策，對境外銀行不徵收任何稅款，不要求繳存準備金，每年只收取1萬巴林第納爾的許可費。
投資銀行的性質居於商業銀行與境外銀行之間，可以與居民之間開展銀行業務，但不準吸收活期存款和辦理透支，亦不繳存準備金。可發行有價證券，提供有關債券買賣的技術諮詢和吸收公司客戶活期存款等。由於巴林對投資資本管理很鬆動，所以資本投資市場發展較快。
其他金融機構，有巴林伊斯蘭銀行、房屋建築銀行，以及社會保險組織。
非銀行金融機構主要有保險公司、各類基金會和貨幣交易公司等。其中，各類保險公司、社會保險基金會近20家，貨幣交易公司6家。非銀行金融機構主要從事中、長期固定利率證券投資。只有貨幣交易公司充當巴林當地客戶與歐洲、遠東金融市場之間的中介人。它們吸收本幣或外幣活期、短期儲蓄存款，代客經營歐洲定期大額存單或其他短期票據。
