shRNA是short hairpin RNA 的縮寫。翻譯為“短髮夾RNA”。shRNA包括兩個短反向重複序列,中間由一莖環(loop)序列分隔的,組成髮夾結構,由pol Ⅲ啟動子控制。
隨後在連上5-6個T作為RNA聚合酶Ⅲ的轉錄終止子。在活體中輸送“小干擾RNA”(siRNA)的一種辦法是,將siRNA序列作為“短髮夾”克隆進質粒載體中。當送入動物體內時,該髮夾序列被表達出來,形成一個“雙鏈RNA”(shRNA),並被RNAi通道處理。然而,對成年小鼠肝臟中shRNA的表達的長期效應所做的一項研究為我們敲響了警鐘。該研究結果表明,很多shRNA在小鼠中表達時是有毒的。這種經常是致命的毒性似乎是由shRNA與內生微RNA之間為與Exportin-5結合所展開的競爭造成的。Exportin-5是一個參與將分子輸送出細胞核的因子。人們對開發基於shRNA的療法非常感興趣,而此前幾乎沒有證據表明shRNA在活體中有很強毒性。