小核糖體RNA

小核糖體RNA (Small rDNA-Derived RNA,srRNA),這一新概念的提出較易引起爭議,主要是在於srRNA很容易被認為是rRNA隨機降解的產物。

概念,研究進展,

概念

srRNA主要分布在rDNA的編碼區並和正義鏈相匹配。利用擬南芥、果蠅和人的Agronaute (AGO)蛋白免疫共沉澱的小RNA高通量測序數據分析發現,srRNA可以和AGO蛋白特異性結合。進一步的小鼠糖尿病模型研究發現,srRNA的表達譜和糖尿病存在相關性。並且利用細胞模型的初步研究發現,srRNA具有生物學功能。

研究進展

近日,中科院上海生命科學研究院營養科學研究所翟琦巍研究組提出了小核糖體RNA (Small rDNA-Derived RNA,srRNA)這一新概念,並初步發現srRNA和糖尿病存在相關性並具有生物學功能。相關論文線上發表在近期的《PLoS ONE》雜誌上。
該研究團隊認為srRNA的存在並具有生物學功能有其合理性。首先,tRNA來源的小tRNA (tRNA-derived small RNA, tsRNA)這一概念目前已逐漸被接受,具有生物學功能的tsRNA可以看作是tRNA的降解產物,因此與之類似的rRNA降解產物具有生物學功能也有其合理性。當然,srRNA是否主要來源於rRNA的降解還需要進一步研究。另外,srRNA的序列和豐度分布是具有特異性的,其在rDNA上的豐度分布並不是隨機的,而是存在特徵峰的,這提示srRNA至少並不完全是隨機降解的產物。其次,srRNA可以特異性地和AGO蛋白結合,提示其可能和miRNA等一樣具有生物學功能。初步的生物學功能研究也確認了srRNA具有生物學功能。再次,目前已知的很多小RNA是與rDNA完全匹配的,也就是說這些已知的小RNA就是srRNA。
srRNA這一新概念的提出,一方面會加深對於小RNA的理解,另一方面會引起研究人員對於srRNA在不同生理病理過程中的作用和機制的重視,為糖尿病等疾病的診斷和治療提供新的思路。

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