寶雞市生態環境局是將市環境保護局的職責，市發展和改革委員會的應對氣候變化和減排職責，市國土資源局的監督防止地下水污染職責，市水利局的編制水功能區劃、排污口設定管理、流域水環境保護職責，市農業局的監督指導農業面源污染治理職責整合組建市生態環境局，作為市政府組成部門。
內設機構,現任領導,
內設機構
（一）辦公室
負責機關政務工作，督促檢查機關工作制度的落實；負責機關會議的組織和決定事項的督辦；負責文電、機要、檔案、信訪、保密、接待、計畫生育、精神文明、綜合治理、後勤服務等工作；負責人大議案、建議和政協提案的辦理等工作；組織擬訂全市環境保護規劃並指導實施；承擔機關財務和資產管理工作；承擔全市排污費繳庫工作；承擔環境保護專項資金管理；承擔環境保護方面的對外合作與交流；承擔全市環保項目管理工作；組織實施環境保護宣傳教育綱要，組織開展生態文明建設和環境友好型社會建設的宣傳教育工作。
（二）人事教育科
負責機關和所屬單位的機構編制、幹部人事、勞動工資、社會保障、教育培訓、人才開發、專業技術職務評聘等工作；負責離退休人員的服務管理工作；負責組織實施目標責任考核及獎懲工作。
（三）法制科
承擔全市環境保護有關規範性檔案的合法性審核、備案工作；承擔機關行政複議、行政應訴等工作，指導和監督環境保護依法行政工作；負責市級行政處罰案件的審查工作；組織開展全市環保行政執法稽查工作；指導協調全市環境信訪、投訴的調查處理工作，開展環境經濟政策研究並組織落實。
（四）總量控制與環境應急科
負責對全市主要污染物總量控制工作實施統一規劃、指導、協調、監督和考核；指導協調排污許可證、環境統計和污染源普查工作。擬訂全市環境監測規劃和環境監測質量管理制度並組織實施；組織開展環境監測工作；組織編制並發布全市環境狀況公報；擬訂市級突發環境事件應急預案，指導全市環境應急管理工作，指導和協調重大突發環境事件的應急處置工作；協調市級環境監控平台的管理。
（五）污染防治與輻射安全管理科
擬訂大氣、水體、噪聲、惡臭、機動車、光污染防治和固體廢物、醫療廢物、危險廢物、化學品管理方面的規範性檔案並組織實施；組織擬訂全市大氣、水污染防治規劃並監督實施；指導開展重點區域大氣污染聯防聯控與集中整治；監督管理城鄉工業污染源的污染防治和飲用水源地環境保護；組織實施跨流域、跨區域水污染和大氣、聲環境質量考核等環境管理制度；指導實施重金屬污染防治；指導實施清潔生產工作；協調指導核安全、輻射安全、放射性廢物監督管理工作。承擔核事故、輻射環境事故應急工作；對核設施安全、放射源安全和電磁輻射、核技術套用、伴有放射性礦產資源開發利用中的污染防治實施監督管理；對核材料的管制和民用核安全設備的設計、製造、安裝和無損檢驗活動實施監督管理。
（六）環評與科技科
負責規劃環境影響評價、項目環境影響評價管理工作；監督檢查環境影響評價機構；監督落實建設項目環境保護“三同時”制度；負責環境保護科技工作；承擔市級環境科技成果的鑑定、交流與推廣工作；參與指導和推動循環經濟與環保產業發展。
（七）農村與生態保護科
指導、協調、監督全市生態環境保護工作；組織編制生態保護和農村環境保護規劃；提出新建及調整的各類自然保護區申報建議，組織開展對各類自然保護區保護工作進行監督檢查；組織協調生物多樣性保護；指導協調農村環境保護工作，指導實施農村環境綜合整治；組織開展全市生態狀況評估；指導開展生態系列創建；組織開展土壤污染防治。
（八）監察室
監察室按有關規定設定並開展工作。
現任領導
寶雞市生態環境局黨組書記：趙一鍵
