審計經組織體系指執行審計一方即審計主體的組織系統。從國內外審計的發展和現狀來看，審計按不同主體劃分為政府審計、內部審計和註冊會計師審計；並相應地形成了三類審計組織機構，共同構成審計組織體系。政府審計是由國家審計機關代表國家依法進行的審計。政府審計主要監督檢查各級政府的財政收支以及政府機構公共資金的財務收支情況。目前世界各國政府建立的審計機構，因領導關係不同而分為三種類型：（1）由議會直接領導並對議會負責；（2）在政府內建立審計機構並對政府負責，政府則對議會負責；（3）由財政部門頸導，在財政部門內部設審計機構兼管財政監督，實行財政、審計合一制度。從審計的獨立性、權威性來講，由議會領導最為適宜，我國目前的審計機關由政府領導，分中央地方兩個層次。我國憲法規定，審計機關獨立行使審計、監督權，不受其他行政機關、社會團體和個人的干涉。內部審計是由各部】、各單位內部設定的審計部門進行的審計。內部審計主要監督檢查本部門、本單位的財務收支和經營管理活動。目前世界各國內部審計部門的設定，因領導關係不同而大體分為三種類型：①受本單位總會計師或主管財務的副總裁領導；②受本單位總裁或總經理領導；③受本單位董事會領導。從審計的獨立性、有效性來講，領導層次愈高，愈有保障。我國目前的內部審計部門一般由本部門、本單位的主要負責人領導，業務上接受同織國家審計機構或上一級主管部門審計機構的指導。相對外部審計而言，內部審計的獨立性較弱。註冊會計師審計是由經政府有關部門審核批准的註冊會計師組成的會計師事務所進行的審計。註冊會計師審計面向社會，從事企業查帳驗證和會計諮詢服務等業務。在西方國家，註冊會計師的工作機構有獨資、合夥兩種主要形式。獨資是指由一個註冊會計師獨立開業成立的會計師事務所，它具有除專業資格要求以外一般獨資企業的一切特點。合夥是指兩個或兩個以上的註冊會計師共同出資、經營的會計師事務所，除對合伙人專業資格的要求外，它具有一般合夥企業的一切特點。在我國，會計師事務所是註冊會計師的工作機構，註冊會計師必須加入會計師事務所才能接受委託，辦理查帳驗證、會計諮詢等業務。會計師事務所不附屬於任何機構，自收自支、獨立核算、自負盈虧、依法納稅、具有法人資格，因此在業務上具有較強的獨立性、客觀公正性，並且為公眾所承認，為社會所接受。在審計組織體系中，政府審計、內部審計和註冊會計師審計三方，既相互聯繫.又各自獨立、各司其職，涇渭分明地在不同的領域實施審計。它們各有特點，相互不可替代，因此不存在主導和從屬的關係。從發展的觀點來看，隨著政治上的逐步民主化，以監督國家經濟活動為主要特徵的政府審計，將在更多的國家實施；隨著企業規模的逐步擴大化和內部管理的科學化，內部審計將得到更大的發展；隨著經濟的逐步商品化、市場化，註冊會計師審計將在整個審計組織體系中占據日益重要的地位。
