孫磊，男，畢業於清華大學，現就職于山東大學生命科學學院，研究員。生物信息學博士，現任山東大學博士生導師。
人物經歷,研究方向,主要成就,
人物經歷
教育背景：
2014.09 - 2019.10 清華大學 生命科學學院 生物信息學博士
2012.12 – 2013.06 烏普薩拉大學 生態中心 交換生
2010.09 - 2014.06 山東大學 泰山學堂 生物學學士
工作經歷：
2022.12 山東大學 生命科學學院 研究員
2019.11-2022.11 清華大學 生命科學學院博士後
研究方向
1. 技術開發方面
孫磊實驗室對實驗和計算方法的開發都很感興趣。孫磊實驗室參與了許多技術的開發，包括亞細胞RNA結構測定（Sun et.al., NSMB, 2019 ）和基於人工智慧的RBP-RNA相互作用預測（Sun et.al., Cell Research, 2021）。孫磊實驗室還對單細胞RNA結構測定，共轉錄瞬時RNA結構測定等問題感興趣。
2. 解決生物學問題方面
RNA結構和RBP-RNA相互作用在轉錄後調控中起著關鍵作用。孫磊實驗室可以通過icSHAPE、PrismNet、CLIP等技術從RNA結構和RNA-蛋白相互作用的角度研究病毒的調控網路，並通過靶向病毒的重要結構元件或相互作用的宿主蛋白來開發抗病毒藥物（Sun et.al., Cell, 2021）。上述的研究思路，即整合高通量測序、深度學習和實驗驗證，為系統研究RNA結合蛋白的作用提供了一個可行且高效的思路。孫磊實驗室也可以研究RBPs在斑馬魚發育過程中是如何調節基因表達的等其他科學問題。
3. 技術套用方面
基於之前的工作，孫磊實驗室已經確定了大量與RNA翻譯、RNA降解等相關的保守RNA結構元件。這些RNA結構可以被利用來設計RNA分子，更好地幫助疫苗和RNA靶向藥物的開發。
主要成就
8. Zhang, J.*, Fei, Y.*, Sun, L.#, and Zhang, Q.C#. (2022). Advances and opportunities in RNA structure experimental determination and computational modeling. Nature Methods 19, 1193-1207.（2022）
7. Sun, L. *, Li, P. *, Ju, X. *, Rao, J. *, Huang, W. *, Zhang, S., Xiong, T., Xu, K., Zhou, X., Ren, L., et al. In vivo structural characterization of the whole SARS-CoV-2 RNA genome identifies host cell target proteins vulnerable to re-purposed drugs. Cell, 184, 1865-1883. (2021)
6. Sun, L. *, Xu, K. *, Huang, W. *, Yang, Y.T. *, Li, P., Tang, L., Xiong, T., and Zhang, Q.C. Predicting dynamic cellular protein-RNA interactions using deep learning and in vivo RNA structure. Cell Research, 31, 495-516. (2021)
5. Zhang, S., Huang, W., Ren, L., Ju, X., Gong, M., Rao, J., Sun, L., Li, P., Ding, Q., Wang, J., et al. Comparison of viral RNA-host protein interactomes across pathogenic RNA viruses informs rapid antiviral drug discovery for SARS-CoV-2. Cell Research. 4;1-15 (2021)
4. Sun, L., F. M. Fazal, P. Li, J. P. Broughton, B. Lee, L. Tang, W. Huang, E. T. Kool, H. Y. Chang# and Q. C. Zhang# "RNA structure maps across mammalian cellular compartments." Nature structural & molecular biology, 26 (4), 322-330 (2019).
3. Liu, Z. , J. Wang, H. Cheng, X. Ke, L. Sun, Q. C. Zhang and H. W. Wang "Cryo-EM Structure of Human Dicer and Its Complexes with a Pre-miRNA Substrate." Cell 173, 1191-1203 e1112, (2018).
2. Li, P. , Y. Wei, M. Mei, L. Tang, L. Sun, W. Huang, J. Zhou, C. Zou, S. Zhang, C. F. Qin, T. Jiang, J. Dai, X. Tan# and Q. C. Zhang# "Integrative Analysis of Zika Virus Genome RNA Structure Reveals Critical Determinants of Viral Infectivity." Cell Host Microbe 24, 875-886 e875, (2018).
1. Piao, M., L. Sun and Q. C. Zhang# "RNA Regulations and Functions Decoded by Transcriptome-wide RNA Structure Probing." Genomics Proteomics Bioinformatics 15, 267-278, (2017).
