基本建設收入審計是對建設單位在基本建設過程中所取得的各項副產品收入的發生、分配、上交和使用情況所進行的審核、稽查。主要內容是：(1)檢查基本建設收入是否真實、合法。為了調動建設單位的積極性，國家對基本建設收入實行分成留用的管理辦法。為了防止建設單位將其他應上交國家的資金記入基本建設收入，審計機構必須逐筆核實基本建設收入，對不屬於基本建設收入的資金，督促企業按規定上交或管理。
(2) 檢查基本建設收入是否全部入帳，帳務處理是否正確。一方面，檢查建設單位有無私設“小金庫”隱匿資金現象，會計核算是否正確; 另一方面，檢查建設單位出售副產品是否執行國家價格。(3) 檢查基本建設收入分配、上交情況，建設單位必須以全部基本建設收入為基數與有關部門分成，並及時上劃資金。(4) 檢查基本建設收入使用情況。留用的基本建設收入，應轉作企業基金，按規定用途使用。企業不得隨意挪用基本建設收入。通過對基本建設收入的審計，可以保證國家利益，維護財經紀律。
