基於iTRAQ技術高通量篩選梅毒血清固定血清學診斷標誌物

基於iTRAQ技術高通量篩選梅毒血清固定血清學診斷標誌物

《基於iTRAQ技術高通量篩選梅毒血清固定血清學診斷標誌物》是依託南昌大學,由陶小華擔任項目負責人的地區科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:基於iTRAQ技術高通量篩選梅毒血清固定血清學診斷標誌物
  • 項目類別:地區科學基金項目
  • 項目負責人:陶小華
  • 依託單位:南昌大學
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

梅毒血清固定發生率高,機制不清,尚無有效的處理措施,成為梅毒有效治療的最大障礙。現有的梅毒診斷試驗方法須長期、反覆檢測才能初步診斷梅毒血清固定,且對判斷病情活動性、是否侵犯腦脊液的敏感性和特異性低。前期,我們採用對早期梅毒(一期、二期)患者血清進行了比較蛋白質組學研究,證實了該方法篩選梅毒血清標誌物的可行性。本項目擬通過收集早期梅毒(病期小於2年)病例建立佇列,對患者給予正規治療並隨訪12個月,隨訪期結束根據血清和腦脊液檢測結果分為組,利用iTRAQ技術篩選血清標誌物,並通過生物信息學分析,預測血清標準物的結構及編碼基因,並通過Western blot、PCR、ELISA對上述預測蛋白質進行驗證。最後,利用受試者工作特徵曲線盲法評價SSF血清標誌物診斷敏感性及特異性。本項目研究結果有望對梅毒血清固定的合理診斷及治療具有積極的意義。

結題摘要

現有的梅毒診斷試驗方法須長期、反覆檢測才能初步診斷梅毒血清固定,且對判斷病情活動性、是否侵犯腦脊液的敏感性和特異性低。本項目通過收集早期梅毒(病期小於2年)病例建立佇列,對患者給予正規治療並隨訪12個月,隨訪期結束根據血清和腦脊液檢測結果分為組,利用iTRAQ技術篩選血清標誌物,並通過生物信息學分析,預測血清標準物的結構及編碼基因,並通過Western blot、PCR、ELISA對上述預測蛋白質進行驗證。最後,利用受試者工作特徵曲線盲法評價SSF血清標誌物診斷敏感性及特異性。最終共發現89個差異蛋白點,其中兩個或兩個以上肽段進行定量鑑定的蛋白有72個,採用單個肽段進行定量鑑定的蛋白有12個。分別用DATA ANALYSIS 4.0軟體與WARP-LC軟體分析質譜數據,MASCOT搜尋質譜匹配蛋白,在鑑定出的72個蛋白點中,以正常組為對照,其中有12個差異表達蛋白具有統計學意義,其中9個表達上調,3個表達下調,這12個差異蛋白的功能涉及到Tp表面蛋白、補體系統、糖蛋白等。通過擴大樣本驗證,TP023診斷梅毒血清固定的診斷閾值是免疫組化評分≥3,經統計分析其CRC診斷特異度為92.7%,敏感度為78.5%,陽性預測值為93.4%,陰性預測值為80.8%,在該診斷閾值下,計算收受者特徵曲線(ROC)的曲線下面積(AUC)為89.4%。TP029診斷結梅毒血清固定的診斷閾值是免疫組化評分≥4,經統計分析其CRC診斷特異度為96.5%,敏感度為65.8%,陽性預測值為94.4%,陰性預測值為72.6%,在該診斷閾值下,ROC的AUC為84.2%。本項目研究結果對梅毒血清固定的合理診斷及治療具有積極的意義。

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