《基於LC-MS技術的CTCL生物標誌物的發現及其生物學意義研究》是依託復旦大學,由郁韻秋擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:基於LC-MS技術的CTCL生物標誌物的發現及其生物學意義研究
- 依託單位:復旦大學
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:郁韻秋
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
我們前期的研究已經發現T細胞淋巴瘤(cutanous T cell lymphoma, CTCL)患者的代謝組與正常人之間存在著顯著性差異。因此,本項目擬運用代謝組學的研究理念,以LC-MS為技術平台,以CTCL患者血漿/清為研究對象,尋找CTCL特異性標誌物,目的是繪製其代謝輪廓,建立其早期診斷模型;進一步構建不同免疫表型和預後的區分模型。研究的成果將為CTCL的早期診斷提供證據,並有利於對CTCL的分型和預後的判斷。由於代謝組學與基因組學,轉錄組學和蛋白質組學均屬於組學技術,它們既自成體系又密切聯繫,是一個完整的系統。獨立組學的研究關注於某個局部體系,容易以偏概全,因此本項目還將嘗試組學間的關聯研究,把代謝組學研究的數據與我們前期研究的microRNA結果(屬轉錄組學)作比對,以期獲得信息之間的呼應和關聯,結合臨床數據和特點,驗證和修正模型,從而獲得對疾病更為清晰和全面的認識。
結題摘要
【研究意義】皮膚T細胞淋巴瘤(cutaneous T cell lymphoma, CTCL)是一原發於皮膚的惡性T細胞性腫瘤,是最常見的T細胞的惡性病變之一,而且目前仍缺乏特徵的、非創傷性的技術來進行早期診斷,而早期診斷無論對患者還是臨床醫師都意義重大。因此,尋找CTCL的生物標記物,通過測定體液(血液、尿液等)這些簡便、非創傷性的檢測手段來進行早期診斷,是臨床上迫切需要解決的問題。【研究技術和對象】本項目運用代謝組學的理念,採用UHPLC-QTOF/MS(超高壓液相色譜-質譜聯用技術),以CTCL患者血漿為研究對象,為發現CTCL的生物標誌物展開研究。【研究目標】尋找CTCL 血漿中的特異性生物標誌物,繪製其代謝輪廓,為建立早期診斷模型提供依據。【完成情況】本項目依照研究目標和時間,完成項目計畫書中所列的各項任務,內容涉及:CTCL患者的樣本收集;色譜條件選擇和最佳化以及方法學驗證;考察數據採集和分析過程中的各種影響因素;數據採集和分析;生物標誌物的發現和研究。【研究成果】通過此項研究,得到CTCL患者和正常人兩組間差異化較大的化合物列表(超過600個化合物,P>0.05);篩選出36個化合物為潛在生物標誌物;其中已有4個得到驗證和確認;研究結果還表明這些代謝物主要是磷脂膽鹼類和胺基酸類物質。以上工作的歸納和總結已經撰寫研究論文1篇,題目為“Metabolomic investigation of CTCL based on UHPLC-QTOF/MS”,投稿雜誌為:CLINICAL BIOCHEMISTRY。