基於高通量測序的細菌sRNA-靶標mRNA相互作用識別研究

《基於高通量測序的細菌sRNA-靶標mRNA相互作用識別研究》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院，由李伍舉擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：基於高通量測序的細菌sRNA-靶標mRNA相互作用識別研究
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：李伍舉
• 依託單位：中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院

中文摘要

細菌sRNA是細菌中普遍存在的一類長度在40～500個核苷酸的調控RNA，主要通過與靶mRNA結合實現基因表達的轉錄後調控，進而在細菌毒性、群落感應和對外界環境的反應等方面發揮重要作用，因此，開展細菌sRNA-靶標mRNA相互作用研究具有重要意義。本項目擬綜合運用高通量測序等生物技術與RNA二級結構預測等生物信息學方法系統開展細菌sRNA-靶標mRNA相互作用研究，該策略可以同時識別細菌sRNA及其靶標mRNA，不僅為闡明特定條件下細菌sRNA功能提供實驗指導，也為開發細菌sRNA及其靶標預測模型提供數據支持，最終促進細菌sRNA功能基因組學研究和人們對細菌生命活動的理解。

結題摘要

在該課題資助下，我們按計畫主要開展了以下研究。1，基於高通量測序的RNA-RNA相互作用預測研究，發現體外條件下測定的RNA相互作用不能完全真實反映體內的RNA相互作用；2，基於高通量測序的大腸桿菌中RNA-RNA 相互作用研究，建立了相應實驗技術與生物信息學注釋分析平台，構建了相應資料庫和網路伺服器 ；3，構建了細菌sRNA靶標資料庫及sRNA功能線上注釋系統，以及sRNA-mRNA組合調控預測模型及相應伺服器。基本完成預定研究目標。