基於表觀遺傳性質及調節網路對長非編碼RNAs的功能注釋

科研成果

序號	標題	類型	作者
1	CRISPR相關的生物信息學基礎	期刊論文	陶洋\|李金城\|廖奇\|
2	機器學習方法在功能注釋中的套用	期刊論文	李金城\|廖奇\|沈其君\|
3	女性精神分裂症者蛋白編碼基因和非編碼RNA的DNA甲基化譜分析	期刊論文	Dongjun Dai\|Yuzheng Zhang\|高樹貴\|段世偉\|
4	lncRNAs功能注釋和預測	期刊論文	余鋮亮\|駱亮\|廖奇\|
5	鑑定和預測長非編碼RNAs的生物信息學方法	期刊論文	陳思佟\|岑益\|柳建發\|廖奇\|
6	大腸癌長非編碼RNA的研究進展	期刊論文	李金誠\|葉孟\|陶洋\|廖奇\|
7	長痱編碼RNAs在表觀遺傳上的作用	期刊論文	潘廣惠\|高濤\|鄭啟\|廖奇\|
8	利用RNA-seq數據全基因組挖掘瘧原蟲的長非編碼RNA	期刊論文	趙亞\|鄭煥欽\|趙屹\|吳忠道\|
9	男精神分裂症者蛋白編碼基因和非編碼RNA的DNA甲基化譜分析	期刊論文	Jinfeng Li\|Honglei Yin\|高樹貴\|段世偉\|
10	全面挖掘大腸癌長非編碼RNA的表觀遺傳譜	期刊論文	陶洋\|李金城\|張曉宏\|趙進順\|
11	大腸癌發生高DNA甲基化的長非編碼RNA的挖掘及功能注釋	期刊論文	駱亮\|李金城\|李洋\|段世偉\|

項目摘要

隨著測序技術的發展，越來越多的長非編碼RNAs（lncRNAs）在人和鼠中被發現。這些lncRNAs主要對蛋白編碼基因起調節作用，參與眾多重要的生物過程，然而大部分lncRNAs的功能卻未知，因此，挖掘lncRNAs的功能仍然是目前生物信息學家面臨的重大課題。本項目中，申請者根據lncRNAs在表觀遺傳上的作用特點，提出兩種功能注釋方法：一是利用GEO資料庫中的表觀遺傳修飾數據，挖掘lncRNAs在各種生物過程下的DNA甲基化狀態和組蛋白修飾情況；二是基於已有的lncRNA-靶基因關係和各種表觀遺傳修飾特徵，分別採用交集法和貝葉斯網路統計模型預測lncRNAs調節的靶基因，構建表觀遺傳調節網路從而對lncRNAs的功能進行注釋。申請者希望通過以上兩種方法，獲得lncRNAs可能參與的生物過程，並對部分lncRNAs的功能進行實驗驗證，為進一步深入了解lncRNAs的作用機制提供研究線索。

基於表觀遺傳性質及調節網路對長非編碼RNAs的功能注釋

基本介紹

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