《基於石墨烯納米孔器件的DNA單分子探測研究》是依託北京大學,由趙清擔任負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:基於石墨烯納米孔器件的DNA單分子探測研究
- 項目負責人:趙清
- 項目類別:面上項目
- 依託單位:北京大學
《基於石墨烯納米孔器件的DNA單分子探測研究》是依託北京大學,由趙清擔任負責人的面上項目。
《基於石墨烯納米孔器件的DNA單分子探測研究》是依託北京大學,由趙清擔任負責人的面上項目。項目摘要納米孔由於其可以在單分子量級上實現對生物分子結構的測量,引發了前沿交叉領域極大的關注與科研熱情。基於固態納米孔的DNA測序...
本項目提出一種基於石墨烯和納米孔的新型DNA測序方法基礎研究。主要思想是利用石墨烯和矽構造一種納米孔-腔-孔結構(GPCP),當單鏈DNA分子在靜電場驅動下穿過GPCP時,造成納米孔離子電流阻塞和石墨烯電導改變,該電流和電導的變化幅度將實時反映不同的鹼基信息,從而實現雙數據解析測序。項目的主要研究內容包括:亞10nm...
課題組採用分子動力學和非平衡態格林函式結合密度泛函的方法,對二維材料納米孔DNA測序進行了詳細地理論研究。各項研究任務基本按照計畫得以執行。已經完成的主要研究內容如下:(1)尋找到了三種適合DNA測序的新型二維材料,構建了納米孔模型。我們在早期選擇石墨烯做納米孔材料的基礎上,又選擇了二硫化鉬、三磷化鍺和矽烯...
納米孔生物檢測研究,尤其是對寡核苷酸的檢測是單分子生物研究領域的重要方向。基於碳納米管的納米孔系統具有孔徑較小、檢測靈敏度較高等優勢。研究發現ClpXP蛋白酶水解底物過程中,底物蛋白發生受力去摺疊並伴隨多肽鏈轉運過程。蛋白質這種特殊的去摺疊-共轉運行為及其受力幾何關係,可在具有類似形狀的碳納米管系統...
《石墨烯納米孔分解分子的調控機制研究》是依託吉林大學,由王曉春擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 光合作用是生物轉化存儲太陽能的有效方式,對環境無污染。模仿光合作用,開發清潔能源材料,有助於解決霧霾等環境污染問題。本課題擬運用第一性原理計算和實驗檢驗相結合的方法,來研究石墨烯納米孔分解分子和隔離生成...
利用提出的納米製造技術製造石墨烯-氮化矽複合材料納米孔,並用於生物單分子的高靈敏檢測,促進納米孔晶片實驗室、納米孔全基因測序技術的發展。結題摘要 大面積一致性可控的納米結構在科學研究、清潔能源等諸多方面具有廣闊的套用,其製造方法與技術是目前納米科技發展的最前沿技術。本項目理論與實驗相結合,基於STED技術...
清楚理解DNA分子在外電場作用下,穿越微米、納米通道(內徑可<10nm)的詳細機理,對於實現DNA分子(全基因組)納米孔超快測序,實現納米生化感測器、分析器、生物晶片實驗室的高度集成和實用化等有重要的實際價值和科學意義。本項目利用微秒精度脈衝開關、微伏精度恆壓直流源,結合自行研製的微納流控系統,有效引導DNA...
《複合納米孔器件的研製及其穩定性研究》是依託東南大學,由劉全俊擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 本項目基於集成孔內納米電極的固態納米孔器件,在固態納米孔中以分子組裝技術構建表面磷脂雙分子層結構,並在其表面插入生物納米孔,構建一個高度穩定,可重複的複合納米孔檢測器件。通過橫向納米電極反饋控制技術,使得...
因此,我們預計納米孔體系在更廣的範圍內具有能量轉化的潛力,例如存在溫度差的環境中將內能轉化為電能的能力和在不同化學活度下將化學能轉化為電能的過程。 本項目按照研究計畫,開展了兩部分工作。 第一、通過在核孔膜-石墨烯複合材料兩端構建不同溫度條件,實驗數據表明,當孔道兩端存在溫度梯度的時候,孔道中...
當DNA 模板進入孔道時,孔道中的核酸外切酶會“抓住”DNA 分子,順序剪下掉穿過納米孔道的DNA鹼基,每一個鹼基通過納米孔時都會產生一個阻斷,根據阻斷電流的變化就能檢測出相應鹼基的種類,最終得出DNA 分子的序列。納米孔單分子測序技術的一大優勢就是儀器構造簡單使用成本低廉; 因為它不需要對核苷酸進行標記,也不...
本項目將採用聚焦離子束加工平台在氮化矽膜上加工納米孔和相關的電極系統,採用微流控技術構建相關的DNA測序器件。在固態納米孔上直接製備電極系統,構建高頻信號控制及信號採集系統,通過施加脈衝電場和電荷前置放大器檢測相應的電參數。研究DNA序列與信號、噪音之間模型,實現DNA分子上鹼基序列的測定。結題摘要 新一代...
本項目擬建立納米孔單分子檢測平台,基於離子特異性DNA酶對重金屬離子的選擇性結合,設計一系列基於離子特異性DNA酶的的DNA雙鏈探針,以實現多種重金屬離子的檢測。本方法綜合了納米孔單分子檢測及DNA酶對重金屬離子高度選擇性的優點,有望發展一系列快速,靈敏,高選擇性,操作方便的重金屬離子檢測方法。這些研究成果...
本項目我們利用固態納米孔單分子探測技術,探究了單獨四面體摺紙結構以及帶有四面體摺紙標記的雙鏈DNA的穿孔行為。研究表明,單獨四面體摺紙的穿孔行為與雙鏈DNA穿孔行為類似,可以在固態納米孔穿孔電流信號中產生明顯的阻孔信號。納米孔的孔徑對於四面體摺紙結構的穿孔時間會有影響。相同偏壓下,孔徑越小,納米孔與四面體摺紙...
1.3.7固態納米孔感測器的化學修飾 1.4結論 致謝 參考文獻 第2章光鑷集成的固態納米孔在分子檢測和力譜測量中的套用 2.1 引言 2.2實驗方法 2.3 DNA的檢測 2.4力譜測量 2.5建模:電泳與電滲剪 2.6蛋白質塗層的DNA分子的測量 2.7結論 致謝 參考文獻 第3章 適體修飾的納米孔在單分子檢測中的套用 3....
2.表面自旋單量子態的測控。研究表面納米結構及單分子中自旋單量子態的測量,控制,相互作用,及局域環境的調製。期望能利用表面自旋單量子態構築量子比特。3.納米孔中DNA分子動力學研究及測序。研究單個DNA分子在納米孔中的運動規律,實現對DNA分子在納米孔中運動的精準控制。期望能實現單個DNA分子鹼基對序列的無損...
蛋白質通道是生命體中完美組裝的蛋白質納米功能器件。納米通道單分子技術由於在單分子分析、單分子化學反應研究和DNA快速測序等方面的重要價值,已成為目前最熱的研究方向之一。但檢測方法單一,很難小型化、自動化,靈敏度低,選擇性差,且納米通道缺乏對不同分析物的通用性。本研究針對上述瓶頸問題,設計製備了新的...
6.2 DNA單分子力學 6.2.1 單分子力學實驗技術 6.2.2 DNA的單分子力學 6.2.3 小結 6.3 生物納米通道在DNA分子檢測方面的研究及套用 6.3.1 納米孔道檢測的背景 6.3.2 生物納米孔道檢測的工作原理 6.3.3 基於生物納米孑L道的檢測方法和器件 6.3.4 生物納米孔道套用於DNA測序的研究進展 6.3.5 ...
第1章 用於核酸序列分析的固態納米孔感測器 第2章 光鑷集成的固態納米孔在分子檢測和力譜測量中的套用 第3章 適體修飾的納米孔在單分子檢測中的套用 第4章 嵌入生物膜的phi29噬菌體DNA組裝馬達對雙鏈DNA易位和檢測的研究 第5章 用於檢測特異性DNA的固態納米...
第13章 採用光阱技術研究分子馬達的性質 第14章 高分辨雙光阱光鑷的差分檢測 第15章 肌動球蛋白馬達的成像和納米操縱技術 第16章 採用磁阱技術的單分子研究 第17章 利用原子力顯微鏡進行多糖和蛋白質的力學探測 第18章 用納米孔技術進行核酸及DNA-蛋白質相互作用的單分子研究 第19章 無外部負載、具有高...
長期致力於生物醫學材料、納米醫學、分子診斷的研究,以及生物感測、核酸測序、生物電子等工程技術開發,在新型蛋白質納米孔、單分子生物技術、納米孔測序及其臨床分子診斷等領域取得一系列原創成果。他發現雙鏈核酸噬菌體病毒門戶蛋白的門控現象並闡述其機制,構建了碳納米孔及活細胞仿生跨膜通道,開創了基於病毒解旋酶的...
2015年7月任南京大學化學化工學院教授。主要科研方向為具有仿生學概念的單分子納米孔生物感測器的新儀器、新技術的開發,以及基於納米孔的單分子顯微成像技術。其中,在納米孔單分子成像方面具有原創性技術, 具有國際前沿研發水平。人物經歷 2006年於南京大學物理系獲得物理學學士學位;2011年於美國亞利桑那州立大學獲得...
近年集中在納米孔生物感測器、納米孔單分子檢測器件、新型單分子檢測系統的專項研究。已經建立完成了納米孔基因測序系統測試平台,納米孔加工技術及信號分析基礎軟體。學習經歷 1996.9-1999.7 南昌大學生物科學與工程系 碩士 2000.9-2004.12 東南大學生物科學與醫學工程系 博士 研究課題 從事基因晶片製備、相關檢測儀器...
研究方向 1. 單分子分析 2. 腫瘤診療一體化 科研項目 1. 國家自然科學基金面上項目,基於納米孔技術的肺癌相關活性分子檢測及電化學分析機制探索(21874062),65萬元,2019. 1–2022. 12,主持 2. 國家自然科學基金青年項目,基於DNA重組技術檢測腫瘤細胞及細胞內活性物質的研究(21405073),25萬元,2015. 1–2017...
該項研究可套用於研究單個DNA損傷、分析單個多肽結構以及蛋白質構型、探測識別生物分子間弱相互作用、檢測有機小分子化合物和水體中重金屬離子,並有望實現第三代單分子DNA測序。獲獎記錄 第十八屆歐萊雅—聯合國教科文組織“世界傑出女科學家成就獎”頒獎盛典2016年3月在法國巴黎舉行,5位取得突破性成果的傑出女科學家...
2016年,加入清華大學藥學院任特聘研究員,博士生導師,作為課題負責人已獲得三項科技部重點項目資助,領導基於納米孔的新一代基因測序技術的研發。研究方向 納米孔測序核心技術、高通量長讀長測序技術的臨床套用、Point-of-Care核酸檢測技術 等。新一代DNA測序技術是基於單分子連續測序的策略,針對於核酸分子鏈上的鹼基...
這種強大的螢光背景使單分子的螢光探測成為不可能。Pacific Biosciences公司發明了一種直徑只有幾十納米的納米孔[zero-mode waveguides (ZMWs)],單分子的DNA聚合酶被固定在這個孔內。在這么小的孔內,DNA鏈周圍的螢光標記的脫氧核苷酸有限,而且由於A,T,C,G這四種螢光標記的脫氧核苷酸非常快速地從外面進入到孔內...
還包括了一些最新的進展,如SBS技術的新進展(Margulies et al)、核酸染料SBS測序方法(Edwards et al)、通過循環合成實現單分子測序(Hebert and Brasiavsky)、納米孔測序(Lee and meller),以及陣列DNA的游標測(Schwartz et al)。在書的最後,討論了基因組拼接(Mc;rath)中的生物信息學工具、古代和環境...
《腫瘤微環境刺激回響型上轉換光動力診療體系的構建和發展》《石英晶體微天平在腫瘤標誌物檢測中的套用》《複合納米材料Cu₂O@Au對水體中羅丹明B的檢測套用研究》《生物納米孔分析技術研究進展》《Manipulating the hydrophobicity of DNA as a universal strategy for visual biosensing》《Electrochemiluminescence-...