《基於染色體22q13.1-13.31區域深度測序研究Gorlin綜合徵的新致病基因》是依託上海交通大學，由陳萬濤擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：基於染色體22q13.1-13.31區域深度測序研究Gorlin綜合徵的新致病基因
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：陳萬濤
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
Gorlin綜合徵屬常染色體顯性遺傳性疾病，以發育異常和腫瘤易患性為主要特徵。不同種族患者的表型和發病機制不盡相同，目前僅在約50%的患者中發現PTCH基因致病突變，偶見PTCH2及SUFU基因突變引發病變，提示該疾病存在其他致病基因。本課題組前期篩查46個患病家系，發現12個家系致病機制不明，遂以其中一個有5代62個成員的大家係為研究對象，定位了與該疾病連鎖的染色體區段22q13.1-22q13.31；並完成了對該區段的基因組測序工作。本研究擬在前期研究基礎上，通過突變分析及篩選，鎖定候選基因，並在其餘家系中和散發病例中測序檢測、驗證該基因的突變情況。在完成候選新致病基因驗證後，將對其功能和致病機制開展體內、外系統研究。本項目以遺傳家系研究為切入點，旨在獲得具有自主智慧財產權的中國漢人Gorlin綜合徵新的致病基因，探求中國漢人該遺傳病表型特點和分子發病機制，為該疾病的遺傳學診治提供基礎。
結題摘要
口腔癌診治效果的進一步提高，必須依託於對該類腫瘤致病基因的尋找和確定，進而發展新型的診斷和治療技術。本課題選用遺傳性口腔癌和散發口腔鱗癌為研究對象，尋找確定口腔癌致病相關候選基因，並分析其可能的臨床套用價值。 本課題通過中美國際合作，經過SNP 晶片、Merlin連鎖分析及微衛星位點分型連鎖分析，確定一個新的中國漢族人痣樣基底細胞癌綜合徵致病基因所在的染色體區段為22q13.2-22q13.31；進一步對該區域完成了深度測序和分析，分析結果提示EP300及EGCAB6 作為新致病候選基因有一定可能性，這些為新致病基因尋找和研究提供條件。課題研究發現，中國漢族人口腔黏膜鱗癌中 NOTCH1 基因突變情況，該基因的突變較美國高加索人更為頻繁、且功能更為複雜。NOTCH1 基因突變聯合淋巴結轉移可作為口腔鱗癌更好的預後指標；為以NOTCH1 信號通路作為診治靶點，開發口腔鱗癌中診治技術提供不可多得的實驗資料。課題研究還證實， PTHLH在口腔癌中上調錶達，該基因可促進口腔癌細胞的增殖、克隆形成、細胞周期等相關功能；研究分析證實，高表達PTHrP口腔癌患者的臨床預後較差，其表達水平均可作為臨床上判斷口腔癌患者預後的獨立指標。 項目所取得成果為口腔癌致病基因的研究奠定了更堅實基礎，部分研究成果為口腔癌診治提供新的分子靶點。後續研究得到2016年國家精準醫學重點專項-腫瘤分子分型項目資助。該課題已發表SCI收錄論文5篇，參加國際會議交流論文3篇，申請專利2個，獲得省、部級科技成果獎2項；培養研究生4名，其中中美聯合培養2名。
