《基於數據的基因調控網路動態模糊建模及動態特性研究》是依託河海大學,由孫永輝擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:基於數據的基因調控網路動態模糊建模及動態特性研究
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:孫永輝
- 依託單位:河海大學
《基於數據的基因調控網路動態模糊建模及動態特性研究》是依託河海大學,由孫永輝擔任項目負責人的青年科學基金項目。
《基於數據的基因調控網路動態模糊建模及動態特性研究》是依託河海大學,由孫永輝擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要基因調控網路是當前系統生物學和自動控制領域的一個前沿熱點課題,基於微陣列數據的基因調控網路建模將進一步...
《基於基因調控網路研究miRNA可變轉錄介導的調控機制》是依託南京大學,由李捷擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 MicroRNA (MiRNA)是新近發現的功能小RNA,它能與mRNA的3’UTR結合以降低或阻止蛋白的翻譯。miRNA廣泛參與了各種生物過程,其異常表達與諸多疾病相關,是基因調控網路中重要的後轉錄調控子。最近研究...
《基於多尺度耦合特徵的基因調控網路動態演化機制研究》是依託武漢理工大學,由凌光擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 多尺度耦合是基因調控網路的重要特徵之一,廣泛存在於調控數據、拓撲結構、功能構成、時空分布等多個方面。本項目從多尺度耦合的角度出發,結合數據挖掘和複雜網路理論,研究生命現象的多樣性和...
③針對基因調控網路重構:創新提出用模糊神經網路模型來推斷強調控子和相互關聯的模糊規則。將算法得到的調控關係與數據庫中的調控模組進行比較,準確率為84.28%;創新提出基於重連線方法的無標度網路構建算法,用NETI,ARACNE,Banjo運行此模擬剖面算法,證明其具有良好性能;提出邊排序貝葉斯網路結構學習算法,在不同...
《慢性胃炎惡性轉化的基因調控網路及其關鍵節點的研究》是依託上海交通大學,由劉炳亞擔任項目負責人的重大研究計畫。項目摘要 非可治癒性慢性炎症是導致胃癌發生的重要因素之一。因此,了解慢性炎症致癌的機制,從中篩選調控關鍵基因是臨床控制或者干預炎症致癌的實驗基礎。本項目從臨床標本、動物模型和細胞模型三個層面出發...
本項目擬主要基於隱馬爾科夫模型(HMM)建模癌症關聯基因調控通道(Regulatory pathway),並在此基礎上進一步研究基於基因表達譜的癌症診斷問題。首先,結合來自蛋白質組、新陳代謝組等數據的相關先驗信息使用Bayesian、EM方法研究基於調控機率模型(RPM)的基因調控信息提取方法,構建基於RPM的基因評價準則;然後,在有效利用...
《基於PS和CFO1的水稻花器官特徵基因調控網路研究》是依託西南大學,由李雲峰擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 當前,花發育的研究焦點開始從相關基因的克隆轉向基因的表達調控。基於大量的分子證據,人們已經在擬南芥中建立了比較深入的花器官特徵基因調控網路 (FOS-GRN),而關於水稻FOS-GRN的研究還比較少見,目前僅...
《動靜態數據相結合的基因調控網路直接因果關係辨識》是依託清華大學,由周彤擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 直接因果關係辨識是在利用實驗數據探索基因調控網路生物學特性等的研究過程中產生的一個重要理論問題。已有方法大都存在計算複雜度高、假陽/陰性率高、參數估計精度低等不足。本項目擬利用大規模網路中對...
經過課題組四年的科研攻關,項目所有擬定的科研任務都已圓滿完成,研究取得了預期成果:A.在理論方面,提出了多種基因調控關係推導模型獲得了更好的基因網路重構性能,其中,我們發現網路稀疏性以及多數據集成分析在基因網路重構和腫瘤建模研究中發揮重要作用。期間,總計發表相關SCI、EI學術論文14篇,申請發明專利5項,...
本項研究以複雜疾病的基因表達數據分析為基礎,針對複雜疾病的基因調控網路構建及調控機制等科學問題開展相關研究:針對基因表達數據缺失的問題,給出一種基於稀疏表達的數據重建方法;為了有效解決數據相當缺乏的問題,利用小波分析的多尺度特性設計一種跨平台的數據整合方法;針對網路稀疏性的特點,綜合利用互信息和能量函式...
對體細胞轉分化與幹細胞分化過程中的複雜分子調控規律進行研究。綜上,本項目提出了一系列從遺傳干預表達譜改變數據推斷基因調控網路的新算法,並在酵母、線蟲等模式動物上進行了較為系統的套用與檢驗,一些新的基因調控規律預測結果已被濕實驗所證實。
本項課題運用模糊推理研究具有動態特性和模糊現象的複雜系統建模、求解和攝動性分析等相關問題,主要研究內容包括:1.給出動態不確定性信息的度量,建立動態推理模型和推理算法並考察其還原性、連續性和魯棒性等性質;2.給出基於數據驅動的動態模糊系統的構建方法,考察其對一類時滯非線性系統和偏微分方程的逼近精度,...
《秀麗隱桿線蟲的基因調控時空間動態貝葉斯網路研究》是依託廈門大學,由胡杰擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 為研究受精卵發育成擁有不同組織的個體的過程,生物學家以秀麗隱桿線蟲的胚胎為對象,拍攝了大量的4D共焦影片。然而,系統的統計方法的缺乏,阻礙了對這一新穎但高噪聲數據集的全面深入分析。在...
本項目的研究目標是異質性複雜疾病的網路生物標記識別與分析中的可計算關鍵數學模型和高性能共性基礎算法,主要研究內容包括:(1)通過整合基因表達、表觀遺傳、生物分子網路等多層次組學數據建立單樣本網路(即所謂的個性化網路,以克服複雜疾病的異質性導致的困難);(2)發展一套高效的網路生物標記識別模型與算法(...
《基於遺傳進化型模糊神經網路的信用風險評估模型構建及套用》研究的內容主要是從技術層面角度來探討評估信用風險時建模的問題,採用智慧型計算技術(神經網路、模糊邏輯和遺傳算法)建立信用風險評估模型,並運用我國上市公司數據對所構建模型的效果進行驗證和評價。 [1] ...
2、採用已被證實RNA病毒致癌的特性,研究致癌的病毒、siRNA、致癌基因的相互關係,總結和發現癌基因、siRNA和病毒生物調控網路特徵。3、研究siRNA和miRNA的相互關係,從實驗數據和序列特徵比較兩者的作用,認識和發現兩者的序列特徵、生物調控網路特徵,判斷siRNA是否與miRNA的某些調控功能相同。4、採用人工智慧、模糊計算...
我們鑑定了 22735個 RBP–lncRNA 的調控關係,發現單個lncRNA經常受到多個RNA結合蛋白(RBP)的調控。我們也發現RBP和lncRNA的互作可能協同調控基因的表達。整合癌症表達譜數據,揭示了RBP和lncRNA的疾病共表達調控網路。 解析細胞特異性轉錄因子對lncRNA基因轉錄的時空調控,是當前lncRNA研究中極具挑戰性的問題。本...