基於大數據整合挖掘的腎細胞癌分子進化機制研究

《基於大數據整合挖掘的腎細胞癌分子進化機制研究》是依託深圳大學，由黃毅擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：基於大數據整合挖掘的腎細胞癌分子進化機制研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：黃毅
• 依託單位：深圳大學

項目摘要

腎癌是具有高度異質性的惡性腫瘤，其發生和演化的分子進化機制是近年來的研究熱點。我們前期研究提示：腎癌的分支進化模式是其存在廣泛瘤內異質性的遺傳基礎，在晚期進化階段發生的某些亞克隆突變可能與腎癌的浸潤、轉移和療效反應相關。本項目擬以研究“腎癌瘤內異質性及其形成的分子進化基礎”為主線，通過整合我們前期積累的腎癌大數據和海量公共數據資源來系統分析腎癌的分子進化特徵。本研究將採用生物信息學手段深入分析500例以上病人的基因組數據，從點突變、拷貝數變異和結構變異等多個層面入手，解析和構建每個病人的個體化腫瘤演化史。本項目還將綜合利用病人的臨床資料、文獻研究結果和信號通路等信息篩選出少數腎癌晚期進展相關分子事件，在~100例復發或轉移性腎癌病人中進一步評估其功能和臨床意義。本項目可為揭示腎癌發生、復發和轉移過程中關鍵基因突變的功能和作用提供重要信息，為腎癌早期診斷和個體化治療提供新依據。

結題摘要

腎細胞癌是一種異質性較高的腫瘤，不同病理類型腎癌之間基因組特徵差異較大。近年來，腎癌多組學數據量呈幾何級數增長，但數據較分散，深度挖掘整合率低。本項目整合了來自於中國、日本、歐美人群的腎透明細胞癌、乳頭狀腎癌、腎嫌色細胞癌的多組學數據，定量分析腫瘤發生與進展過程中重要的體細胞突變、拷貝數改變、差異表達基因、DNA甲基化等，構建了腎細胞癌分子進化特徵譜，鑑定出了一批與腎細胞癌發生和進展相關的重要分子進化事件及分子靶標的潛在臨床意義，對於認識腎癌的分子異質性及發生髮展進化規律具有一定的學術價值。通過收集和分析中國人四代家系樣本的甲基化特徵，本研究評估了新建立的DNA甲基化分析方法的準確性及特異性，對於研究人類基因組中廣泛存在的等位基因特異性甲基化具有一定的技術指導意義。基於已有的腎癌組學大數據分析篩選，本研究還通過結合腎癌細胞系及~110例腎細胞癌患者組織樣本開展了初步功能學實驗，本研究發現著絲粒蛋白H高表達在腎癌發生與發展過程中發揮了關鍵作用，它可以作為判斷腎癌預後的潛在重要指標。