基於周邊眼軸長度的多性狀全基因組關聯研究

《基於周邊眼軸長度的多性狀全基因組關聯研究》是依託中山大學，由丁小虎擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：基於周邊眼軸長度的多性狀全基因組關聯研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：丁小虎
• 依託單位：中山大學

中文摘要

近視是我國青少年常見的眼病，會引起致盲性併發症，已經成為我國重要的公共衛生問題。近視的病因不明，近年來發現周邊眼球形態影響近視的發生和進展，我們已經提出一種測量周邊眼軸的有效方法，並發表於《Ophthalmology》上。多性狀全基因組關聯研究是分析某個疾病的多個表型，研究疾病的易感基因位點，我們已經開發一款可信度高、具有“可視化”信號源的分析方法。在前期研究基礎上，我們擬利用廣州雙生子研究中的大雙生子為對象，收集其顳側40°和鼻側40°周邊眼軸，以及中央眼軸，利用我們自行開發的分析方法，發現近視的易感基因位點。進一步地，我們利用CRISPR/Cas9 技術定點突變發現的SNPs位點構建SNPs型小鼠，套用CO-IP技術和質譜技術檢測其與該蛋白的結合蛋白種類在野生型和突變型小鼠中的差異，同時結合病理檢查對比兩種小鼠的視網膜和鞏膜的厚度和形態，從而說明SNPs是否在蛋白水平影響近視的進展。

結題摘要

近視是我國青少年最常見的眼病，其病因涉及複雜的遺傳和環境因素。在遺傳方面，近視是一種多基因遺傳病，全基因組關聯研究（GWAS）研究其易感基因的最常用方法。既往近視GWAS研究中，定義近視表型的方法有：基於等球鏡的連續變數，或者近視的二分類變數，以及將中央眼軸長度多做為中間表型分析。但是由於統計軟體的局限性，既往研究是基於某一個表型的單性狀GWAS研究，我們的研究是將近視的多箇中間表型，中央眼軸長度和鼻側周邊眼軸長度和顳側周邊眼軸長度，採用我們團隊開發的專門分析軟體，進行多性狀GWAS分析，試圖發現更多的近視相關的易感基因位點，並通過CRISPR/Cas9 技術定點突變發現的SNPs位點構建SNPs型小鼠，驗證發現的易感基因位點。按照原研究計畫，2017年，我們收集了466例12-27歲青少年右眼的中央眼軸長度、顳側40度周邊眼軸長度，鼻側40度周邊眼軸長度，並利用RegUDA的多性狀GWAS分析軟體進行數據分析，研究沒有發現預期的顯著統計學位點，為了避免經費資源的浪費，該項目既定的動物模型研究部分並沒有如期進行。該研究結果已經在2018年年度報告中做出說明，並上報國家基金委審核。 針對該問題，2019年，我們組織專家討論，擬選擇近視GWAS研究中，最先發現，也是最恆定發現的易感基因--GJD2基因進行相關的動物模型研究。目前，該部分動物實驗正在進行中，這就導致了經費支出的延遲。在進行該課題同時，我們的基因型數據共享至全球的近視GWAS研究聯盟--CREAM中，並作為Collaborators作者發表論文於Nature Genetics上。同時，該國家自然科學基金也資助了在本人在近視的其他相關研究，並發表論文在Invest Ophthalmol Vis Sci雜誌上。最後，該基金剩下的研究內容和經費支出將於接下來的2年內完成。