基於光微流雷射陣列的快速準確DNA分析與篩查

基於光微流雷射陣列的快速準確DNA分析與篩查

《基於光微流雷射陣列的快速準確DNA分析與篩查》是依託太原理工大學,由范旭東擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:基於光微流雷射陣列的快速準確DNA分析與篩查
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:范旭東
  • 依託單位:太原理工大學
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

實現完全配對與單鹼基錯配DNA檢測對疾病診斷和生化基礎研究具有非常重要的意義。高分辨熔解曲線分析(HRM)是近年來興起的一種簡便、可實現DNA突變快速掃描的後聚合酶鏈反應技術。然而隨著序列長度的增加,不同DNA所產生螢光強度差異越來越小,將難以分辨。 本項目提出一種基於光微流雷射的腔內高靈敏度HRM檢測方法,可用來分辨具有上千鹼基對的DNA序列,所需樣品低至納升量級。DNA樣品及螢光素被用做雷射器增益介質,與傳統HRM相比:(1) 雷射取代螢光被用做感測信號,利用共振腔極強光反饋,有望將傳統HRM中的感測信號差提高數千至數萬倍;(2)利用雷射器由受激輻射到自發輻射銳利相變過程,可精確標定不同DNA熔解溫度;(3)提供了一種保持溫度恆定,檢測信號強度隨激發光強變化這一快速、高通量的新型檢測方法;(4)與PCR及微流控技術高度兼容,可實現晶片上檢測。本項目的實現可推動生物醫藥套用和相關研究領域的發展。

結題摘要

實現完全配對DNA與單鹼基錯配DNA的精確、快速檢驗對疾病診斷與基礎生化研究等的發展具有重要意義。本項目提出一種基於穩定平面凹面(p-c) FP微腔的光流控雷射陣列,該微腔有亞pl模體積。該FP腔採用雷射燒蝕技術在熔融石英玻璃表面上製備微凹面結構,然後在其表面上鍍上多層分布布拉格反射(DBR)介質層封裝製成。達到了高的品質因數為5.6×10^5,超過通常所用的FP腔100倍。以1mM 溶於酒精的R6G染料作為增益介質,得到90nj/mm的超低閾值。高的精細度和低的雷射閾值使得我們的FP腔的性能接近光流控環形諧振腔雷射器的性能。光流控環形諧振腔雷射器具有創紀錄的高精細度(和q因子)和低雷射閾值。因為生物疾病檢測普遍存在著檢測靈敏度低、所需樣品量大的現象,本項目中的FP雷射諧振腔滿足生物疾病檢測所需要的高靈敏度、使用樣品量少以及容易集成等要求。 本項目提出一種新型的基於FP腔的光微流控雷射器的DNA高解析度熔融(DNA-HRM)分析方法。與傳統的HRM相比,基於雷射的HRM具有信噪比高、溫度解析度高以及容易集成等優點。另外,還可以通過調Q技術和降低泵浦強度等手段降低熔解溫度。本項目主要分析了多種長度以及多種類型的DNA。在單鹼基替換型DNA中分析了長度由25個鹼基對至兩種GC含量的130個鹼基對DNA。對單鹼基變異DNA(SNP)也進行了實驗分析。SNP是人類基因可遺傳變異中最常見的一類疾病,對SNP的快速準確檢驗對人類疾病檢測具有重要意義。 對此,我們提出了一種在固定溫度下掃描DNA的方法,這種方法是傳統的HRM所不能使用的。實驗結果顯示錯配DNA與正配DNA或者SNP變異後DNA與未變異DNA之間的斜率是不同的。而後我們也對G-四鏈體(一種DNA的高級結構)進行分析研究。G-四鏈體與人類癌症細胞有重要關聯,合理利用G四鏈體具有治療癌症的潛能。 本項目的開展進一步推動了微流控雷射晶片檢測技術的套用,同時推動了生物醫藥套用和相關領域的發展。

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