基因組結合蛋白(genome-linked protein)是2012年公布的微生物學名詞。
基本介紹
- 中文名:基因組結合蛋白
- 外文名:genome-linked protein
- 所屬學科:微生物學
- 公布時間:2012年
基因組結合蛋白(genome-linked protein)是2012年公布的微生物學名詞。
基因組結合蛋白(genome-linked protein)是2012年公布的微生物學名詞。定義一種病毒編碼的小分子蛋白質,通過磷酸二酯連線酶的作用,其胺基酸黏附於某些病毒的病毒粒子核酸的5′端。出處《微生物學名詞》第二...
組蛋白基因(histone gene) 組蛋白基因是已知的重複基因中唯一具有蛋白質編碼機能的基因。它們在DNA合成開始前短暫地表達,因而它的活動與細胞周期密切相關。技術原理 基因組中存在大量重複序列用以編碼組蛋白是有其重要意義的。DNA複製時,組蛋白也要成倍增加,而且往往在DNA合成一小段後,組蛋白馬上就要與其相結合,...
《真核生物mRNA poly(A)結合蛋白(PABP)功能及調控研究》是依託華東師範大學,由王傳貴擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 真核生物基因轉錄和翻譯分別在細胞核和細胞質中進行,大多數新合成的mRNA要經過3' Poly(A)化才能被運輸出核進而在細胞質中完成翻譯。一類Poly(A)結合蛋白(PABP)能特異結合mRNA Poly(A)...
1.真核生物基因組DNA與蛋白質結合形成染色體,儲存於細胞核內,除配子細胞外,體細胞內的基因的基因組是雙份的(即雙倍體,diploid),即有兩份同源的基因組。2.真核細胞基因轉錄產物為單順反子。一個結構基因經過轉錄和翻譯生成一個mRNA分子和一條多肽鏈。3.存在重複序列,重複次數可達百萬次以上。4.基因組中不...
蛋白組學是源於蛋白質與基 因組兩個詞的雜合,意指“種基因組所表 達的全套蛋白質”,即包括一種細胞乃至一 種生物所表達的全部蛋白質的研究。相對於 基因組學,蛋白質組學旨在認識細胞內全部表達蛋白,包括表達蛋白的數目、水平及其 更新,它們的序列和一切轉譯後對序列的修 飾,以及蛋白與蛋白、蛋白與其他分子...
DNA結合位點(英語:DNA binding sites)是存在於DNA上的與其它分子相綁定的各類結合位點。DNA結合位點與其它結合位點的區別在於:(1)它們是DNA序列(如一個基因組)中的一部分;(2)它們被DNA結合蛋白所綁定。DNA結合位點常常與一類被稱為轉錄因子的特殊蛋白相聯繫起來,並因此聯繫到轉錄調控。針對特定的一個轉錄...
《基於結構的DNA結合蛋白結合殘基預測及結合特異性分析》是依託武漢大學,由劉娟擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 結構基因組計畫產生了大量蛋白質結構數據,其中相當部分功能未知,揭示它們的功能是當前重要任務之一。蛋白質往往通過與其他蛋白質及/或核酸的相互作用行使功能,其中,蛋白質與DNA結合幾乎在細胞遺傳活...
基因組學(genomics)的概念最早於1986年由美國遺傳學家Thomas H. Roderick提出。基因組學是對生物體所有基因進行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究的一門交叉生物學學科。基因組學主要研究基因組的結構、功能、進化、定位和編輯等,以及它們對生物體的影響。簡介 基因組學的目的是對一個生物體所有基因進行集體...
《(CGG:GCC)短重複序列結合蛋白的大規模篩選和功能研究》是依託中山大學,由吳蘇擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 近年研究發現,基因組非編碼序列中的短重複序列(微衛星序列)不僅是染色體某些特殊結構的組成部分(如端粒),有些對基因轉錄調控也具有重要作用。(CGG:GCC)三聯短重複序列顯著性出現在...
《DNA與蛋白質作用的全基因組分析》是依託東南大學,由陸祖宏擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 新一代DNA測序技術的出現給在全基因組水平上開展DNA和蛋白質相互作用的研究帶來了重大的機遇。本項目旨在發展基於新一代高通量DNA測序技術的DNA和蛋白質相互作用的研究平台,使之能夠在全基因組水平上進行特定組織和細胞...
轉錄激活因子樣效應子(TAL effectors)已廣泛套用於靶向基因組操作蛋白的製備:通過融合表達核酸酶、轉錄因子或其他功能的結構域構建位點特異的內切酶(TALEN)、靶基因轉錄調控因子(TALE-TFs)或者其他基因組修飾蛋白。TALE融合蛋白通過TALE特異性識別結合染色體上靶序列進行靶向基因組編輯,比如基因敲除、基因敲入(結合使用...
AgRP結合MSH受體並充當配體結合的競爭性拮抗劑。AgRP在腎上腺的表達受糖皮質激素的調節。該蛋白質可阻斷α-MSH誘導的皮質酮分泌。發展歷史 在哺乳動物,硬骨魚和鳥類基因組中分別發現了AgRP,ASIP,MCIR和MC4R的AgRP直系同源基因。這表明在過去的5億年中,刺鼠-黑皮質素系統起源於相同的配體和受體基因。肥胖相關性 AgR...
真核生物的轉錄由三種類型的RNA聚合酶進行,每種RNA聚合酶需要一種稱為啟動子的特殊DNA序列和一組DNA結合蛋白(轉錄因子) 來啟動該過程。 RNA聚合酶I負責核糖體RNA(rRNA)基因的轉錄。 RNA聚合酶II(Pol II)轉錄所有蛋白質編碼基因以及一些非編碼RNA(例如snRNA,snoRNA或長非編碼RNA)。 RNA聚合酶III轉錄5S ...
構建的融合蛋白需要得到表達,因此可選擇質粒表達載體。首先需要確定載體。質粒表達載體必需的條件包括選擇標記、複製起點、啟動子、起始密碼子、多克隆位點和轉錄終止子。T7啟動子系統是常用的表達系統,含有T7啟動子、核糖體結合位點、起始密碼子、多克隆位點和轉錄終止子。T7啟動子的RNA聚合酶有特殊菌株的基因組表達...
並且,基因的表達方式錯綜複雜,同樣的一個基因在不同條件、不同時期可能會起到完全不同的作用。關於這些方面的問題,基因組學是無法回答的。所以,隨著人類基因組計畫的逐步完成,科學家們又進一步提出了後基因組計畫,蛋白質組(proteome)研究是其中一個很重要的內容。在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分...
如ΦX174的H基因和A基因之間的序列(3906-3973),共67個鹼基,包括RNA聚合酶結合位,轉錄的終止信號及核糖體結合位點等基因表達的控制區。乳頭瘤病毒是一類感染人和動物的病毒,基因組約8.0Kb,其中不翻譯的部份約為1.0kb,該區同樣也是其他基因表達的調控區.6.病毒基因組DNA序列中功能上相關的蛋白質的基因或rRNA...
基因表達可以體現出功能基因組與非功能基因組、健康個體與患病個體、轉基因作物與非轉基因作物之間的差異。為了及時跟進這一研究方向的實驗方案,內容涵蓋染色質免疫沉澱反應、拓撲學研究、光致交聯、FRET和成像技術。作為《分子生物學方法》系列叢書的一卷,《DNA-蛋白質互作:原理與實驗方案》文字流暢、信息全面,各章均...
非組蛋白具有多樣性和異質性,不同組織細胞中其種類和數目都不相同。非組蛋白對DNA 具有識別特異性,識別信息來源於DNA 核苷酸序列本身,識別位點存在於DNA 雙螺旋的大溝部分。識別與結合靠氫鍵和離子鍵。在不同的基因組之間,這些非組蛋白所識別的DNA 序列是保守的。非組蛋白具有多方面的重要功能,包括基因表達的...
本項目屬於前沿性研究,希望能夠解決蛋白質結合位點結構比對研究中的幾個難點問題,從而促進結構基因組學、蛋白質功能和藥物設計領域的研究步伐。結題摘要 項目組在國家自然基金61202309的資助下,開展了蛋白質與蛋白質結合位點結構比對方法的研究工作,項目組以結構生物信息學方法研究蛋白質與蛋白質結合位點結構比對問題,...
除了蛋白質編碼基因之外,人類的基因組還包含了數千個RNA基因(由RNA組成),其中包括用來轉錄轉運RNA(tRNA)、核糖體RNA(rRNA)與信使RNA(mRNA)的基因。其中轉錄rRNA的基因稱為rDNA,分布在許多不同的染色體上。 調控序列 人類基因組含有許多不同的調控序列,並以此來控制基因表現。這些序列是典型的短序列,會出現在靠近基...
在1980年代,Yahli Lorch和羅傑·科恩伯格(Roger Kornberg)表明,核心啟動子上的核小體體外阻止了轉錄的啟動,麥可·格倫斯坦(Michael Grunstein)證明組蛋白在體內抑制轉錄,導致核小體為 一般基因阻遏物。結構組成 組蛋白是存在於染色體內的與DNA結合的鹼性蛋白質,染色體中組蛋白以外的蛋白質成分稱非組蛋白。絕大部分...
含有HD的蛋白是轉錄因子,可激活或抑制靶基因的表達。脊椎動物中同源盒基因家族很大,按一個基因組中10萬個基因估計超過0.2%的基因含有同源盒[2]。傳統上同源盒基因分為兩個亞家族,一類是成簇排列在染色體上,並按前後軸(antero-posterior,A-P)方式表達,稱之為A-P型,即Hox基因或Ⅰ類同源盒基因。另一類是...
蛋白質組學(Proteomics)處於早期“發育”狀態,這個領域的專家否認它是單純的方法學,就像基因組學一樣,不是一個封閉的、概念化的穩定的知識體系,而是一個領域。主要功能 蛋白質組學集中於動態描述基因調節,對基因表達的蛋白質水平進行定量的測定,鑑定疾病、藥物對生命過程的影響,以及解釋基因表達調控的機制. 作為...
我們整合了來自15種腫瘤類型的約7000樣本的癌症基因組數據,鑑定了大批失調的lncRNA,預測了大批跟病人預後相關的lncRNA。此外,分析癌症基因組數據,我們揭示了RNA結合蛋白在癌症中呈現下調的趨勢,鑑定了200多個作為癌症驅動的RBP基因。我們進一步通過功能實驗驗證了6個RNA結合蛋白在結腸癌和肝癌的重要功能。 以上的...
當RNA與蛋白質在結合前後構象變化不大時,該方法能較好地模建RNA-蛋白質複合物結構。隨著解出的蛋白質結構與RNA結構增多,該方法在基因組尺度對RNA-蛋白質相互作用靶點進行識別,以及功能RNA分子設計方面有具有潛在的套用價值。此外,由於實驗測定的RNA-蛋白質相互作用數據在構建相互作用的理論模型的研究中比較重要,...
Britten和Davidson於1969年提出的真核生物單拷貝基因轉錄調控的模型——Britten—Davidson模型。該模型認為在整合基因的5’端連線著一段具有高度專一性的DNA序列,稱之為感測基因。在感測基因上有該基因編碼的感測蛋白。外來信號分子和感測蛋白結合相互作用形成複合物。該複合物作用於和它相鄰的綜合基因組,亦稱受體基因,...
結構:鋅指核酸酶由兩個部分組成:鋅指蛋白(Zinc Finger Protein, ZFP)和Fok1核酸內切酶。鋅指蛋白是由多個鋅指結構串聯而成,用於識別和結合特定的基因序列。Fok1核酸內切酶具有特異性的切割能力,通過二聚化形成一個有效的切割複合物,可以切割真核基因組中的任何特定識別序列。鋅指蛋白中的DNA識別域由一系列Cys2-...
組蛋白在翻譯後的修飾中會發生改變,從而提供一種識別的標誌,為其它蛋白與DNA的結合產生協同或拮抗效應,它是一種動態轉錄調控成分,稱為組蛋白密碼(Histone code)。背景介紹 遺傳特異性由基因組鹼基序列決定,序列變化導致細胞行為改變。但是科學發展到今天,這已不是問題的全部。有人提出"表觀遺傳學"概念,表觀...
美國麻薩諸塞州麻省理工學院和哈佛大學broad研究所所長lander說:“已完成的人類基因組序列在準確率、完整性和連續性方面遠遠超過了我們的預期目標。它反映出全球數百名科學家為了一個共同目標——為21世紀的生物醫學奠定紮實的基礎——而進行大協作的奉獻精神。”僅有2萬~2.5萬個蛋白編碼基因 ihgsc最新分析所得出...