《基因組水平計算進化方法的研究和套用》是依託東南大學，由顧萬君擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：基因組水平計算進化方法的研究和套用
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：顧萬君
- 依託單位：東南大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
隨著測序技術的廣泛套用，如何對產生的大量基因組數據進行快速準確的進化分析已經成為當前生物信息學和比較基因組學研究的前沿課題。在本申請書中，我們首先提出了在貝葉斯分析過程中採用新的採樣方法來降低進化分析的計算複雜度，實現基因組數據的快速進化分析。同時，我們提出將已知的生物信息整合到進化模型中，開發一系列複雜進化模型來準確模擬分子進化過程，通過複雜模型的套用來提高進化分析的準確性。以上進化方法學的改進將為我們使用基因組數據深入準確認識生物進化的過程和機制提供了有效的工具。最後，我們提出將方法學的研究成果套用到人類基因組的進化分析中，通過對人類全基因組的適應性進化分析，進一步尋找與人類特有功能密切相關的基因組功能區域。本項目的完成，將大大提高我們處理大量基因組數據的能力，幫助我們更好的認識基因組中隱藏的生命信息。
結題摘要
隨著DNA測序技術的廣泛套用，如何對產生的大量基因組數據進行快速準確的進化分析已經成為當前生物信息學和比較基因組學研究的前沿課題。本青年基金對基因組尺度的計算進化方法進行了研究，開發了DNA分子進化模型，研究了基因翻譯和miRNA-mRNA相互作用過程中的調控機制，並開發了能夠進行基因組尺度計算進化分析的分子進化軟體。主要研究進展包括：1、提出了一種新的採樣方法來降低貝葉斯分析過程的計算複雜度；2、開發了一個新的DNA分子進化模型，在模型中考慮了同義突變對於分子進化的影響；3、研究了一些基因組中特定功能區間所出現的進化選擇作用；4、開發了一個能夠進行大量基因組數據進化分析的軟體工具PLEX。本項目的研究成果對於基因組水平的數據的分子進化研究具有一定科學價值，能夠提高我們處理大量基因組數據的能力，幫助我們更好的認識基因組中隱藏的生命信息。
