生活垃圾中有機物的腐爛分解，不可避免地將產生惡臭污染。惡臭污染源主要來自進廠的原始垃圾，垃圾運輸車在卸料過程中和垃圾堆放在垃圾儲坑內散發出帶惡臭的氣體，其主要成分為硫化氫、氨氣等。
為了控制焚燒廠產生的惡臭，可以採取以下措施：
（1）垃圾本身是有臭味的，因此不排除運輸沿路有臭味，這方面，主要是採用密閉性、具有自動裝卸結構的運輸車來運輸垃圾，儘量減少臭味外溢；
（2）垃圾運輸車進入車間後，通過卸料門將垃圾傾倒進垃圾儲坑中。垃圾卸料門為電動提升式，由專人控制，運輸車完成卸料後及時關閉，使垃圾坑密閉化。
（3）垃圾卸料大廳總入口設定空氣幕，以防止臭氣外逸。
（4）垃圾儲坑為密閉式，風機的吸風口設定於垃圾坑上方，使垃圾坑和卸料大廳處於負壓狀態，不但能有效地控制臭氣外逸，又同時將惡臭氣體作為燃燒空氣引至焚燒爐，惡臭氣體在焚燒爐內高溫分解，臭味物質得以清除。為避免臭氣外逸，垃圾卸料大廳和儲坑廠房為封閉廠房。
（5）在廠區四周種植一定數量的高大喬木，減少影響。
（6）為防止在全廠停爐檢修期間，垃圾儲坑的臭氣對周圍環境的污染，由儲坑抽排的臭氣經活性炭廢氣淨化器淨化後排至室外。定期對淨化器出口的臭氣濃度進行檢測，當臭氣出口濃度達到國標控制限值，及時更換淨化器內的活性炭，廢棄的活性炭將與生活垃圾混合進入焚燒爐內進行高溫焚燒處理。
（7）滲濾液處理系統為密閉結構，頂部設導氣管，產生的沼氣以及臭氣通過導氣管、抽風機導入垃圾儲坑。
