國立西北醫學院淵源於1937年創建的國立北平大學醫學院,是現西安交通大學醫學部(原西安醫科大學)、蘭州大學醫學院(原蘭州醫學院)共同的前身。
國立北平大學醫學院1950年改稱為西北醫學院,1956年改稱西安醫學院,1985年更名為西安醫科大學。2000年4月西安醫科大學與西安交通大學、陝西財經學院三校合併,更名為西安交通大學醫學院。2012年6月組建西安交通大學醫學部。
1942年4月,經國民政府批准,以甘肅學院醫學專修科為基礎,組建了“國立西北醫學專科學校”。1945年初夏,將國立西北醫學專科學校併入“國立西北醫學院蘭州分院”。1946年併入國立蘭州大學。1954年,為回響國家大力培養專業技術人員的號召,醫學院分出獨立建院,成立蘭州醫學院。2004年,回並蘭州大學,現為蘭州大學醫學院。