1938年4月，武漢被日寇三面包圍，武漢大學在以楊端六為首的遷校委員會的領導下西遷至四川嘉定（今四川樂山），同時農學院併入中央大學。此時，四年級學生尚留在武漢的學校本部，故樂山的校址稱著國立武漢大學嘉定分校.樂山時期，武大在極其艱苦的條件下，迎難而上，堅持教學與科研工作的正常開展，在最困難的環境裡創造了歷史上最輝煌的成就。時任校長為著名教育學家王星拱.1946年10月，國立武漢大學復員武昌珞珈山，同時恢復農學院，設立醫學院。時任校長為法學家周鯁生教授.
