國家農副產品質量監督檢驗中心(南京)是經國家質量監督檢驗檢疫以國質檢科聯(2004)426號文“關於成立國家農副產品質量監督檢驗中心(南京)的通知”，在南京市產品質量監督檢驗院、江蘇省質量技術監督南京食品農產品檢測中心、南京市農副產品質量監督檢驗中心的基礎上設立的，是大型國家級綜合性食品及農副產品質量監督檢驗機構。
國家農副產品質量監督檢驗中心(南京)
中心擁有檢測設備近150台（套），儀器設備總值為660萬元。包括各類通用食品檢驗分析設備、ICP、氣相色譜質譜聯用儀、液相色譜質譜聯用儀、多台氣相色譜儀、液相色譜儀以及多種檢測器、原子吸收分光光度計、紅外分光光度計等，實驗室面積1200多平方米。中心是國家質檢總局批准的食品生產許可證發證和委託檢驗機構、原國家經貿委全國“三綠工程”辦公室認定的全國食品質量安全定點檢驗機構、美國安捷倫科技公司在華示範實驗室。中心還承擔了食品農副產品質量安全檢測方法江蘇省地方標準的起草工作，開展了食品生產許可證發證及委託檢驗、食品及農副產品質量監督抽查、南京市“菜籃子”產品質量監督抽查、各類食品農副產品委託及驗貨檢驗工作。
中心在食品檢驗能力上，按照固家標準關於食品分類的要求，已具備全部28大類食品的測試分析能力。在農副產品檢驗能力上，已形成了涵蓋GBl8406.1至GBl8406.4―2001《農產品安全質量無公害蔬菜、水產、畜禽肉、水產品安全要求》等國家強制性標準；NY5001－2001《無公害食品韭菜》、NY5003－2001《無公害食品白菜類蔬菜》、NY5044－2001《無公害食品 牛肉》等農業部無公害食品標準；NY/T418―2000《綠色食品 玉米》、NY/T426-2000《綠色食品 柑桔》、NY/T437－2000《綠色食品醬醃菜》等農業部綠色食品標準在內三大類產品近百個標準的檢驗能力。所有檢驗項目均通過國家質量監督撿驗檢疫總局的計量認證(CMA)、機構驗收(CAL)及國家實驗室認可(CNAL)。
主要檢驗項目有：
◆全部28類食品，以及農副產品理化及衛生檢驗項目；
◆有毒有害元素：鎘、鉻、鉛、砷、汞、銅等；
◆食品添加劑：防腐劑、漂白劑、抗氧化劑、甜味劑、著色劑等；
◆農藥殘留：有機磷、有機氯、氨基甲酸酯類、擬除蟲菊酯類、殺菌劑等；
◆藥物殘留：抗生素類、磺胺類、呋喃類、激素類等；
◆衛生指標：菌落總數、大腸菌群、沙門氏菌、致瀉大腸埃希氏菌、致病菌、致病寄生蟲卵等。
