研究擬定進出口食品、化妝品生產、加工、儲存等企業的衛生註冊登記以及陶瓷出口質量許可的工作規章、制度和工作規劃、計畫。
主要職責,機構設定,
主要職責
2．負責出口食品、化妝品生產、加工、儲存等企業的衛生註冊登記和陶瓷出口質量許可的評審、發證和監督管理工作，負責相關重大問題和質量事故的調查處理工作。
3．負責統一辦理向境外推薦企業註冊和組織接待境外主管部門來華檢查工作。
4．負責進口食品、化妝品生產、加工、儲存等企業的註冊評審和監督管理工作。
5．負責衛生註冊評審員的管理工作。
6．負責“危害分析與關鍵控制點”及食品安全管理體系認證的組織推廣和監督管理。
7．研究擬定食品和農產品認證規劃和實施計畫,管理和協調食品和農產品認證體系建設工作。負責食品和農產品認證信息統計分析工作。
8．研究擬定相關食品和農產品認證基本規範、規則，管理和協調食品和農產品認證工作。
9．組織實施食品和農產品認證專項監督檢查工作。
10．承辦委領導交辦的其他事項。
機構設定
（一）註冊一處：
1．研究提出進口食品生產、加工、儲存企業的衛生註冊登記管理制度、規章的草案。
2．研究提出對歐洲（含獨立國協國家）、美洲（植物產品除外）和大洋洲國家（以下簡稱有關國家/地區）進出口食品生產、加工、儲存企業衛生註冊登記工作規劃、計畫，並負責相關管理工作。
3．組織實施對有關國家/地區進出口食品生產、加工、儲存企業的衛生註冊登記的評審、發證和監督管理工作。
4．承辦向有關國家/地區推薦出口食品生產、加工、儲存企業註冊，組織異地評審、複查和註冊通報工作；負責接待相關境外有關機構來華檢查的組織安排工作。
5．承辦衛生註冊評審員的管理等工作。
6．承辦與ASEM、OIE、WTO/SPS·TBT等有關的交流工作以及承辦有關食品衛生註冊管理的國內外合作和技術交流工作。
7．承辦進口食品衛生註冊綜合業務工作。
（二）註冊二處：
1．研究提出出口食品生產、加工、儲存企業衛生註冊登記的管理制度、規章的草案。
2．研究提出對美洲（僅限植物產品）、亞洲和非洲國家（以下簡稱有關國家/地區）實施進出口食品生產、加工、儲存企業的衛生註冊登記工作規則、計畫，並負責相關管理工作。
3．組織實施對有關國家/地區進出口食品生產、加工、儲存企業的衛生註冊登記工作，及相關評審、複查和監督管理工作。
4．承辦向有關國家/地區推薦出口食品生產、加工企業的衛生註冊工作，組織異地評審、複查和註冊通報工作；負責相關境外有關機構來華檢查的組織安排工作。
5．承辦出口食品衛生註冊綜合業務工作。
6．承辦與IPPC、APEC、CAC等有關的交流工作以及承辦GMP、SSOP、HACCP等套用研究和推行工作。
（三）食品農產品認證管理處：
1．研究提出食品和農產品認證的工作方針、法律、法規和規章的草案和建議意見。
2．研究提出食品和農產品認證制度的設立意見，擬定相關食品和農產品認證基本規範、規則，組織管理和協調各項食品和農產品認證工作。
3．承辦食品和農產品認證專項監督檢查的組織實施工作。
4．承辦與食品和農產品認證有關的準則、指南、標準的研究和宣貫工作。
5．承辦食品和農產品認證信息統計分析工作。
6．承辦食品和農產品認證的證書、標誌的管理、監督和協調工作。
7．承辦“危害分析與關鍵控制點”及有關食品安全管理體系認證的組織推廣和監督管理。
8．研究擬定進出口化妝品生產企業的衛生註冊登記和出口陶瓷質量許可、輸美日用陶瓷認證的管理制度和工作規劃、計畫，並負責相關管理工作。
9．承辦本部的綜合工作。
