單鏈構象多態技術

單鏈構象多態性(single-strand conformation polymorphism, SSCP)是一種分離核酸的技術,可以分離相同長度但序列不同的核酸(性質類似於DGGE和TGGE,但方法不同)。SSCP首先由Lee 等[9]用於研究自然微生物群體的多樣性。在低溫條件下,單鏈DNA呈現一種由內部分子相互作用形成的三維構象,它影響了DNA在非變性凝膠中的遷移率。

基本介紹

  • 中文名:單鏈構象多態技術
  • 外文名:single-strand conformation polymorphism
相同長度但不同核苷酸序列的DNA由於在凝膠中的不同遷移率而被分離。遷移率不同的條帶可被銀染或者螢光標記引物檢測,然後用DNA自動測序進行分析。用PCR-SSCP 技術可以進行序列差異的測定,而敏感度會隨著片段長度的增加而降低。但是只要條帶被凝膠電泳分離開就可以進行系統發育的研究。在Schmalenberger 和Tebbe[10]的研究中,測序技術表明一個單鏈也許包括多種序列,電泳條件也會因此影響基因結構的確定進而影響生物多樣性的研究。

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