基本介紹
- 中文名：周巨民
- 國籍：中國
- 職業：研究員
- 畢業院校：復旦大學
基本信息,簡歷,研究方向,承擔科研項目,目前承擔的科研項目,國外承擔的科研項目,代表論著,
基本信息
職 務： 表觀遺傳和基因調控實驗室負者人
學 歷： 博士
通訊地址： 雲南省昆明市教場東路32號 中國科學院昆明動物研究所
簡歷
研究員、博士生導師，基因調控和表觀遺傳學科組負責人。2011年中科院“百人計畫”引進人才。反絕緣子的發現者，已在Cell，Genes Dev.，PNAS，Molecular Cell，MCB，Development 等雜誌發表多篇具有廣泛影響的學術論文，文章被引用超過1000次。並應邀為Molecular Cell，Developmental Cell，MCB，PNAS， Development 等雜誌審稿。
2011.3−現在，中國科學院昆明動物所研究員。
2003−現在， 美國賓夕法尼亞大學 細胞分子生物學研究生部導師（University of Pennsylvania Cell and Molecular Biology Graduate Group， faculty member)。
2003−現在，美國賓夕法尼亞大學 醫學院遺傳學系（University of Pennsylvania School of Medicine Genetics Department) 兼職教授。
2008.1−現在， 美國賓夕法尼亞大學 威斯達研究所（Wistar Institute）基因表達與調控系 副教授。
2000.9−2007.12， 美國賓夕法尼亞大學 威斯達研究所（Wistar Institute）基因表達與調控系 助理教授。
1995.7−2000.8， 美國加州大學伯克利分校分子生物系（University of California at Berkeley，Department of Molecular Cell Biology)博士後(導師：Dr. Mike Levine)。
1990.9−1995.6， 美國德克薩斯大學醫學博士MD安德森癌症研究中心（University of Texas MD. Anderson Cancer)生物化學專業博士（導師: Dr. Eric Olson)。
1986.9−1989.6， 中國科學院上海藥物研究所。
1982.9−1986.7， 復旦大學生物系, 學士學位。
研究方向
遺傳學、基因組學和染色質生物學的發展已將我們對表觀基因組學的認識帶入了一個探索受高度調控的、複雜而有序染色質三維結構的全新時代。這為我們揭示人類發育和疾病的奧秘提供了契機。我們生存的環境與個體的發育和疾病的產生具有密切關係。外界環境可以通過組蛋白或直接對DNA的修飾而影響細胞的功能，最終導致基因表達的變化。我們主要對下面四個涉及發育和疾病的表觀遺傳機制進行研究：
1.反絕緣子PTS (Promoter Targeting Sequence)。要激活一個基因，啟動子和增強子是必不可少的，但是在複雜的基因組內，需要有更多的調控元件參與到這個過程中。絕緣子和反絕緣子就是這樣一對相互作用的DNA元件。前者將不同基因或不同功能的染色質區域分開，而後者可使增強子遠距離、跨越絕緣子激活啟動子。我們在一個控制果蠅發育的重要基因複合體（Hox基因複合體）中發現了這兩種調控元件。我們的首要目標就是揭示這些調控元件的作用機制。
2.CTCF和DNA損傷修復。CTCF是通過絕緣子來起作用的關鍵蛋白, 它也是組織染色質高級結構的核心蛋白，而且它的功能從果蠅到人類，包括一些人類的病原體，如EBV、KSHV、HSV等都是很保守的。我們最近的研究發現CTCF具有保護基因組穩定性的重要功能。CTCF的敲低引起染色體DNA斷裂的增加和DNA損傷修復程度的降低，同時使細胞停頓在G1期。利用免疫螢光和ChIP方法，我們發現CTCF被招募到雙鏈DNA斷裂末端，並參與修復。這一發現使基因組的高級結構和DNA損傷修復有了功能上的聯繫。今後研究的重要方向將聚焦在CTCF被招募和參與修復的機制。
3.DNA損傷與修復蛋白和DNA病毒複製的關係。Ⅰ型單純皰疹病毒(HSV－1)可以起口腔和生殖器皰疹以及嬰幼兒腦炎，因此研究其複製機制十分重要。HSV-1複製能夠激活宿主細胞的DNA損傷應答（DNA damage response, DDR)，並招募相關蛋白，但是部分DDR相關蛋白對病毒是不利的。我們發現HSV-1通過招募CTCF而保護病毒基因組不受其它DDR相關蛋白的抑制。今後的研究將集中在CTCF與病毒複製相互作用機制上。
4. 病毒與宿主相互作用機制和皰疹病毒潛伏感染機制。皰疹病毒感染導致複雜的病毒和宿主的相互作用，其中包括病毒引起的細胞凋亡和對凋亡的抑制、病毒引起的DDR和對DDR的利用和抑制、細胞內在的抗病毒機制和病毒的免疫逃逸。我們利用RNA-seq和ChIP-seq等方法研究了此過程中轉錄組和表觀遺傳學變化規律，發現了包括MiR433和H1.2在內的免疫逃逸和抗凋亡機制。今後我們將探索這些分子的作用機制。
承擔科研項目
目前承擔的科研項目
學科 部門 目前 承擔 項目 任務 | 項目來源 | 承擔項目任務名稱 | 執行時間 | 項目經費 | 已到位經費 |
中科院專項 | 利用樹鼩模型研究絕緣子的功能 | 2011-2014 | 200萬元 | 200萬元 | |
省科技廳 | 皰疹病毒樹鼩模型的建立 | 2012-2015 | 260萬元 | 160萬元 | |
省科技廳 | 海外百名人才計畫 | 2012-2015 | 100萬元 | 70萬元 | |
國家自然基金 | 組蛋白甲基化酶複合物COMPASS催化的H3K4me2,H3K4me3對果蠅發育調控的研究 | 2013-2015 | 20萬元 | 12萬元 | |
中科院“一三五”專項 | 樹鼩模型的建立 | 2013-2015 | 80萬元 | 10萬元 | |
中科院國際人才交流計畫 | 中科院國際人才交流計畫 | 2012-2013 | 20萬元 | 20萬元 | |
中科院重點部署項目 | 染色質高級結構和細胞命運決定分子機理 | 2013-2015 | 100萬元 | 28.5 | |
省科技廳重點項目 | 單純皰疹病毒樹鼩模型的建立及感染機制的研究 | 2014-2016 | 40萬元 | 未到位 |
國外承擔的科研項目
項目類別 | 名 稱 | 研究起止年月 | 資助金額（萬元） | 職責 | 執行情況 |
美國國立衛生研究院 PO1 (NS 33768) | The mechanism of the latency of the Herpes Simplex Virus | 2007-2012 | $130.4364 | 正在進行 | |
出生缺陷基金會 | Identification and characterization of the proteins interacting with the PTS element | 2009-2012 | $25.8418 | 主持 | 正在進行 |
美國國立衛生研究院 R01 GM 65391-01A1 | Dissecting the Functions of a Novel Cis-Element PTS | 2003.04-2008.04 | $151.9344 | 主持 | 已結題 |
出生缺陷基金會 | Facilitating Long Range Enhancer-Promoter Interactions by the PTS Element | 2003.06-2006.05 | $19.1400 | 主持 | 已結題 |
愛德華·馬林克羅特JR. 基金會 | Regulating Enhancer-Promoter Communications in the Hox Gene Cluster by the PTS Element | 2004.10-2005.09 | $10.0000 | 主持 | 已結題 |
關心基金會 | Regulating Enhancer-Promoter Interactions by a Novel Cis Element, PTS | 2002.07-2004.06 | $22.0000 | 主持 | 已結題 |
W. W. Smith 慈善責任機構 | Regulation of long Range gene activation by the Promoter Targeting Sequence | 2002.09-2003.08 | $8.0000 | 主持 | 已結題 |
美國國立衛生研究院，國家癌症研究所,Cancer Center New Investigator Award | Study specialized regulatory DNA element in development | 2001-2005 | $25.0000 | 已結題 | |
聯邦全球研究強化項目 | Pennsylvania Department of health | 2001-present | $20.0000 | 正在進行 | |
白血病研究基金會 | Regulating Enhancer-Promoter Interactions by a Novel Cis Element, PTS | 2001.07-2002.06 | $7.5000 | 主持 | 已結題 |
代表論著
1. Lin Q, Lin L, and Zhou J. (2010). Chromatin Insulator and the Promoter Targeting Sequence modulate the timing of long-range enhancer-promoter interactions in the Drosophila embryo. Developmental Biology，
2. Smith S, Wickramasinghe P, Olson A, LouKinov D, Lin L, Deng J, Xiong Y, Rux J, Sachidanandam R, Sun H, Lobanenkov V, and Zhou J. (2009). Genome wide ChIP-chip analyses of dCTCF reveal important roles for insulator proteins in Drosophila genome organization. Developmental Biology
3. Chen Q, Lin L, Huang J, Smith S, Planck J, Berger S, and Zhou J. (2007) A CTCF dependent boundary exists in the LAT HSV-1 genome to separate latent and lytic specific genes. J Virology
4. Lin Q, Chen Q, Lin L, Smith S, and Zhou J. (2007). The Promoter Targeting Sequence mediates enhancer interference in the Drosophila embryos. PNAS
5. Chen Q, Lin L, Smith S, Lin Q，and Zhou J. (2005). Multiple Promoter Targeting Sequences exist in Abdominal-B to regulate long-range gene activation. Developmental Biology
6. Moon H, Filippova G, Loukinov D, Pugacheva E, Chen Q, Smith ST, Munhall A, Grewe B, Bartkuhn M, Arnold R， Ohlsson R, Zhou J, Renkawitz R, Lobanenkov V. (2005). CTCF is conserved from Drosophila to humans and confers enhancer blocking of the Fab-8 insulator. EMBO Rep
7. ZhouJ，and Berger SL. (2004). Good fences make good neighbors: barrier elements and genomic regulation. Molecular Cell
8. Lin Q, Chen Q, Lin L，and Zhou J. (2004). The Promoter Targeting Sequence mediates epigenetically heritable transcription memory. Genes Dev
9. Lin Q, Wu D, and Zhou J. (2003). The promoter targeting sequence facilitates and restricts a distant enhancer to a single promoter in the Drosophila embryo. Development
10. Zhou J, and Levine M. (1999). A novel cis-regulatory element, the PTS, mediates an anti-insulator activity in the Drosophila embryo. Cell,
11. Zhou J, Ashe H, Burks C, and Levine M. (1999). Characterization of the transvection medating region of the Abdominal-B locus in Drosophila. Development
12. Zhou J, Zwicker J, Szymanski P, Levine M, and Tjian R. (1998). TAFII mutations disrupt Dorsal activation in the Drosophila embryo. PNAS
13. Zhou J, Cai HN, Ohtsuki S, and Levine M. (1997). The regulation of enhancer-promoter interactions in the Drosophila embryo. Cold Spring Harbor Symp Quant Biol, LXII:
14. Zhou J, Barolo S, Szymansky P, and Levine M. (1996). The Fab-7 element of the bithorax complex attenuates enhancer-promoter interactions in the Drosophila embryo. Genes Dev
15. Staudinger J, Zhou J, Burgess R, Elledge SJ, and Olson EN. (1995). PICK1: a perinuclear binding protein and substrate for protein kinase C isolated by the yeast two-hybrid system. J Cell Biol
16. Zhou J, and Olson EN. Dimerization through the Helix-loop-helix motif enhances phosphorylation of the transcription activation domains of myogenin. (1994). Mol Cell Biol
17. Li L, Zhou J, James G, Heller-Harrison R, Czech M, and Olson EN. (1992). FGF inactivates myogenic helix-loop-helix proteins through phosphorylation of a conserved protein kinase C site in their DNA binding domains. Cell
