成立以來,研究院積極與學校其他部門合作,動員並組織具有不同學科背景的教師開展對陶行知的多學科研究和多視角解讀,形成一支匯集不同學科學術骨幹的研究隊伍;組織陶行知研究學術沙龍開展經常性的活動,促進學校陶研工作的開展;主持編寫並出版校本教材《陶行知生活教育理論簡明教程》;在全校開設有關陶研的公選課;組織指導學校大學生陶研會的活動;舉辦了多屆全國性的陶行知教育思想研討班;專門邀請陶研專家來校講學,推動了我校陶研工作的進一步開展;收集、整理、擴充陶研資料,建立陶研資料庫,為研究者提供服務;每年接待參觀陶館的各地來訪者,提供講解等服務。負責編輯出版《生活教育》雜誌,對推動全國的陶行知研究發揮了積極的作用。
陶行知研究院院內機構有研究院辦公室、研究部、行知園和《生活教育》雜誌編輯部4個。
辦公室主要承擔研究院內部的日常管理和部門對外的聯繫工作,處理各類事務,具有上下銜接、溝通和為教職工服務的功能。
研究部是陶研院主要從事陶行知研究的部門,承擔各級各類的陶行知研究項目,負責校內陶行知研究的指導工作,引導學生開展陶行知研究和實踐活動,完成“陶行知教育思想”課程的教學任務。
行知園主要承擔園區的日常管理工作,負責陶行知紀念館的參觀接待工作,介紹陶行知的生平事跡,宣傳陶行知的教育思想,負責陶館的文物保存、維護和安全工作。
《生活教育》雜誌是由中國陶行知研究會和南京曉莊學院聯合主辦的國家一級期刊,編輯部設立在陶行知研究院。主要承擔雜誌的編輯、出版和發行工作。