南京工程學院繼續教育學院成立於2001年03月，由學校成人教育處、江蘇省電力職工大學合併而成，2001年11月學校成立高等職業技術學院，並與繼續教育學院合署辦公。繼續教育學院全面負責學校繼續教育方面的工作，並與學校各專業院系根據需求組織實施。繼續教育學院充分依託學校的教學、科研、實驗等資源條件以外，還充分利用校內、外實習基地，為社會培養生產、建設、管理第一線的高等技術套用型人才。目前，學校繼續教育學院主要負責成人高等學歷教育、遠程教育、自學考試、非學歷教育培訓、技能鑑定等多層次、多類型的人才培養與管理工作。
南京工程學院的成人高等教育起步於上世紀八十年代，為了滿足社會對各類專業人才的需求，開辦成人高等教育、自學考試、專業證書班和技能培訓班，共向社會輸送了成人高等教育、自學考試本專科畢業生和各類人才數萬人。目前，成人高等教育、自學考試設有各類專業三十餘個，有本科、專升本（專接本）、專科三個層次，有函授、自學考試等多種學習類型。繼續教育學院面向社會需求，特別面向機械、電力、核工業等行業，不斷開展各類非學歷教育培訓，以崗位、技能證書培訓和新知識、新技術培訓為主，培訓人數上萬人，為需要獲得各種證書或進行知識更新的求學者提供服務。
