北京市衛生會計核算服務中心是北京市衛計委直屬單位,負責匯總衛生系統各單位各類財務報表,並進行財務分析;負責本系統會計人員有關培訓工作及本系統會計資格認證、驗證的有關事務性工作;負責管理本系統會計人員的業務檔案;負責本系統財會網路及軟體的建設與維護工作;承擔委託單位的會計核算工作。