北京市藥品檢驗所是北京市食藥局直屬單位，主要職責：負責藥品、生物製品、藥品包裝材料、潔淨區（室）、藥用輔料、醫療器械等質量檢驗（抽驗、委託檢驗、進出口檢驗）與技術仲裁檢驗，保健食品、化妝品的許可檢驗、監督檢驗、評價檢驗和安全風險監測檢驗；承擔新藥及新醫院製劑的技術覆核工作；參與各類標準的起草與修訂；承擔檢驗用對照品、標準品的協作標定及分發工作；承擔檢驗方法及產品質量的科學研究工作；承擔本市各類檢驗人員的業務指導和培訓完成上級主管部門交辦的監督任務。
