分子資料庫生物信息學涉及的資料庫可大致分為二種：初級資料庫和二級資料庫。初級 資料庫貯存原始的生物數據，如 DNA 序列，由晶體衍射(Crystallography)獲得 的蛋白質
基本介紹
- 中文名：分子資料庫
- 分為：初級資料庫和二級資料庫
- 獲得 ：Crystallography
- CHEMIDPLUS：MedKoo Biosciences
全球免費讓公眾使用的化合物及藥物分子資料庫
（注意： 以下信息來自於美國MedKoo Biosciences， Inc。）
1.美國國家醫學圖書館化學身份證（CHEMIDPLUS）資料庫
該網頁可檢索藥物化學結構，本網站可以用藥物名稱查找其化學結構. 此外,本資料庫還可以查看毒性, 理化性質, 藥品代碼等。
2. 美國國家醫學圖書館PUBCHEM資料庫可檢索藥物化學結構
本資料庫是美 國國家健康研究所（NIH）和美國國家醫學圖書館（NLM)的大型藥物分子庫。NIH 是美國醫學研究機構，下設27個機構和中心，也是美國健康與人類服務部的一個組成部分。它是一個重要的聯邦機構，執行和支持基礎、臨床及可轉化醫學研究， 調查普通及罕見疾病的原因、治療及治癒情況。PubChem資料庫是美國國家衛生署分子庫路線圖計畫的一個組成部分，是由NIH國家生物技術信心中心開發 的一個化學結構及分子生物活性綜合資料庫.
3。 美國國家癌症研究所（NCI）抗癌藥藥物詞典
該數據收集了4000多條與癌症醫學相關的術語和化合物性質。
4. 藥物合成資料庫（Drug SynthesisDatabase）
該數據是這個藥物線上網推出的數據 庫.本資料庫提供近7000種已上市或在研藥物的藥物合成相關的信息，如藥品名、結構式、化學名、CAS登記號、分子式、分子量、化學活性、開發階段、研 究機構等。最大的優點是快速檢索合成路線，並給出參考文獻來源。
檢索條件支持模糊查詢，各輸入條件間的檢索關係為邏輯與（即AND關係）。檢索條件選擇其一即可查詢。檢索方法包括：
*藥物名稱：（註：包含通用名、商標名、研發代號、異名等）。如Loratadine、Cefpirome.
*化學名稱：（註：包含CA命名、普通命名等）。
*CAS登記號：（註：美國化學文摘登記號）。
5. 有機合成方法資料庫
Since 1921, OrganicSyntheses has provided the chemistry community with annual collections ofdetailed, reliable, and carefully checked procedures for the synthesis oforganic compounds. Some procedures describe practical methods for thepreparation of specific compounds of interest, while other proceduresillustrate important synthetic methods with general utility. Each procedure iswritten in considerably more detail as compared to typical experimentalprocedures in other journals, and each reaction and all characterization datahas been carefully "checked" for reproducibility in the laboratory ofa member of the Board of Editors.
Organic Synthesesprocedures may be accessed either via the tables of contents of individualvolumes ("journal mode") or by conducting structure and keywordsearches ("database mode"). Specific in dividual procedures can beaccessed via the table of contents for either the original annual volume orcollective volume in which the procedure appeared. "Database mode"allows users to simultaneously search all volumes of Organic Syntheses bykeywords or by inputting structures and substructures. Structure searchingrequires the ChemDraw plugin which can be downloaded according to theinstructions found in the left margin. Articles from future volumes of OrganicSyntheses that are not yet incorporated in the searchable database can beaccessed on the "Org Syn Express" page.
6. 有機合成人名反應
該資料庫是藥物線上網推出的數據 庫.TheOrganic Name Reactions (ONR) section is intended to serve the professionalchemist and student by describing organic chemical reactions which have come tobe recognized and referred to by name within the chemistry community. A selectgroup has been chosen for addition to this section. Each reaction descriptionis designed to be informative and representative of the pertinent literature;however, it is not meant to be comprehensive. The descriptions are composed ofthe following: (1) name(s) associated with the reaction, (2) the originaland/or primary contributor(s) connected with the discovery and/or developmentof the reaction, (3) a concise description of the transformation, (4) areaction scheme, (5) key references, and (6) cross references to other ONRbased on commonalities. The index included in this section also listssupplementary terms.
7. 有機合成反應庫
該數據可是這個藥物線上網推出的資料庫.含有400多個有機合成人名反應。
8. 化學物質索引資料庫（Chemical IndexDatabase）
該資料庫是藥物線上網推出的資料庫。 本資料庫為化學物質特性資料庫，包含大量具藥理活性及生物活性的物質性質信息數據。檢索條件支持模糊查詢，各輸入條件間的檢索關係為邏輯與（即AND關 系）。化學結構式為矢量格式圖片，可利用系統自帶圖片預覽工具或支持該格式的工具進行無損縮放查看。檢索結果包括：（a) 索引信息：如物質名稱、化學結構式圖、化學文摘登記號(CAS)、CA名稱、商標名、化學結構式、分子式、分子量、元素組成等。(b) 參考文獻：提供公開物質理化性質、製備方法、分析方法、藥理藥效、臨床研究等的重要期刊、專利、綜述等極具參考價值的文獻。(c) 物質特性：包括理化特性數據，如熔點、沸點、閃點、溶解性、多晶物質狀態、光譜吸收特徵數據、藥物治療分類等.
其檢索的方法有：
*物質名稱(英文名)：（包含化學名、通用名、商標名、異名等的全名或部分(大於3個字元)，如Ceftriaxone,Adefovir.）
*CA登記號(CAS Registry Number)：
*注:美國化學文摘登記號
*參考文獻(Literature References)
*藥理活性(Keywords)
*用途(Usages)
*治療分類(Therapeutic Category)
*分子式(Molecular Formula)
*分子量(Molecular Weight)
*熔點(Melting Point)
*注:熔點值,以攝氏度為單位
*沸點(Boiling Point)
*注:沸點值,以攝氏度為單位
*解離常數(pKa)
*比旋度(Optical Rotation)
*油水分配係數(LogP)
*最大吸收值(Absorption Maximum)
*密度(Density)
*折光率(Index of Refraction)
*毒性數據(Toxicity)
