劍橋結構資料庫系統(The Cambridge Structural Database System,簡寫為CSDS)是基於X光和中子衍射實驗唯一的小分子及金屬有機分子晶體的結構資料庫,收錄了全世界範圍內所有已認可的有機及金屬有機化合物的晶體結構。
基本介紹
- 中文名:劍橋結構資料庫系統
- 外文名:The Cambridge Structural Database System
劍橋結構資料庫含有875,000個有機及金屬有機化合物的X射線和中子射線衍射的分析數據。本資料庫不僅全面涵蓋了已發表的分子晶體結構,同時也獨特的收錄了大量在其它任何地方無法獲得的分子結構數據。資料庫中的每一條信息都包括:
1、三維結構數據:原子坐標、晶胞參數、空間群、結構精密度指標、溫度與壓力條件、 無序分布細節
2、二維結構圖:原子和鍵的性質與關聯
3、化學式和化合物名稱,多肽化合物的胺基酸序列
4、完整的文獻資料,其中部分直接與電子版文獻連線
5、交叉引用立體異構體及有關重新解釋和確認的詳情
6、其它已發表的與該分子有關的信息:化合物來源、結晶條件、結對構型的確定實驗、 多晶型現象(同質多像)及生物活性
該資料庫中所有的分子結構都經過了廣泛、細緻的查證,並提供了詳盡的化學和文獻方面的信息,從而更加提高了晶體結構數據的價值。該資料庫不斷收錄最新發表的數據信息,並以年9%的增長率不斷更新。
CSDS包括功能完整的套用軟體,不僅具有數十種查詢化合物的方法,還提供了分子結構信息統計方法和三維圖像演示方法,以幫助研究人員尋找、觀察、分析和總結有關的化合物信息。CSDS軟體分為基本軟體系統和圖形軟體系統。
套用範圍:
1、搜尋、顯示晶體結構
2、分析分子參數
3、研究構象取向
4、搜尋藥效團模型
5、檢測分子內和分子間相互作用
6、快捷地提取與分析分子的幾何結構
7、預測分子間相互作用
8、確認特定官能團間相互作用的模式
9、檢索相似的晶胞堆積特性
10、計算晶胞堆積相似度等
CSDS每年有三次數據更新,劍橋晶體資料庫中心(CCDC)每年年底發布新版本的CSDS。
CSDS操作平台:Windows/UNIX/LINUX/Mac OX。